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随着经济发展和生活水平提高，功能性农产品越来越获得消费者的喜爱。本文以食用菌作为功能性农产品中的代表，利用47国双边贸易数据，分析在当前绿色壁垒日益凸显的形势下，功能性农产品的贸易特征及影响其出口的因素。结果表明，功能性农产品以欧美市场需求最大，出口国GDP、进口国人均GDP、同一贸易集团、共有领土边界和殖民历史对于两国之间的功能性农产品贸易额提高具有显著正向影响；两国距离和进口国与出口国之间农药最大残留标准数目之差，即绿色技术型壁垒显著减少了食用菌的贸易额；向发达国家出口时还可能遭遇关税和技术性壁垒的双重制约。最后对以中国为代表的出口国家提出了相应的贸易政策及启示。