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目的:分析猫细小病毒CC-1株VP1基因的序列,并与国内外代表性的毒株进行比较。
方法:根据CenBank登录的猫细小病毒(CU-4)VP1基因序列,设计了一对引物用PCR技术对VP1基因进行整体扩增,将扩增产物纯化后克隆人PGM—T载体,通过酶切、PCR和测序进行验证。
结果:测序拼接得出VP1基因的序列长度约为2306bp,该基因的ORF总长为2184bp,编码727个氨基酸,应用DNAstar软件把所测得的序列与国内外代表性毒株的VP1基因编码区全长核苷酸序列和氨基酸序列进行比对分析,发现CC-1株与国内XJ-1株的核苷酸和氨基酸同源性均为99.3%。
结论:VP1基因全长基因的序列分析,对临床和流行病学的研究具有重要意义。