花魔芋多酚氧化酶PPO基因的分子特性及序列分析

来源 :2014年中国魔芋产业发展研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wcp
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以花魔芋幼叶叶片为材料,提取花魔芋幼叶总RNA,反转录cDNA.根据Gnebank中薯芋类等PPO基因设计简并引物,采用同源克隆方法得到花魔芋PPO(PPO)基因763bp的cDNA片段.通过5′-Race和3′-Race分别得到611bp和426bp大小的cDNA片段,最终得到PPO全长cDNA序列2071bp,GC含量65.14%,开放阅读框位于385~1836bp处,加尾信号(AATAAA)位于第1931bp处.通过cDNA推导得到的氨基酸序列分析表明,PPO编码484个氨基酸残基,预测蛋白分子量为55.17 kD,pI为9.32,经Smart-emb1预测其含2个典型的PPO1 DWL和PPO1 KFDV保守结构域,分别位于序列第276~329和第351~409位氨基酸残基处,还有一个酪氨酸酶核心保守域结构位于第60~270位氨基酸残基处,预测结果显示其含有15个α-螺旋和5个β-折叠结构.
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