桂枝芍药知母汤被广泛用于治疗类风湿性关节炎，然而，由于缺乏适当的研究手段，其作用机制尚不明确。本研究采用将药物靶标预测，网络分析和实验验证相结合的方法，探讨桂枝芍药知母汤抗类风湿性关节炎潜在的分子机制。基于化合物结构相似性原理，针对已知165个桂枝芍药知母汤所含化学成分，预测得到77个候选靶点。再建立相应的药物-靶标分子网络，通过计算网络中各节点和边的拓扑特征值(包括节点连接度、紧密度和介度，边介度)，筛选出一条与桂枝芍药知母汤抗类风湿性关节炎作用密切相关的信号轴。它由两个桂枝芍药知母汤候选靶标，即HDAC1(组蛋白去乙酰化酶1)、HSP90AA1(热休克蛋白90 ku alpha A类1)和三个已知的抗类风湿性关节炎治疗靶标，即NFκB2(细胞核因子/κ基因结合核因子)、IKBKB(B细胞中κ轻多肽基因增强抑制剂，激酶β)和TNF-α(肿瘤坏死因子α)组成。这条信号轴在药物-靶标分子网络中，沟通了各功能模块的相互作用，而这些功能模块又参与了多条类风湿性关节炎相关通路，如T/B细胞受体信号通路、Toll样受体信号通路、NF-kappa B信号通路、TNF信号通路和破骨细胞分化等。进一步的体内和体外实验验证也表明，桂枝芍药知母汤对于类风湿性关节炎具有一定的病情改善作用，且其机制可能是通过扭转炎症-免疫系统失衡和调节HDAC1-HSP90AA1-NFKB2-IKBKB-TNF-α信号轴来实现的。