目的：比较SPIO、CM-DiI及EGFP标记西藏小型猪骨髓间充质干细胞的优缺点,为进一步研究MSCs移植后在动物体内示踪提供实验依据。方法：利用密度梯度分离法、贴壁培养西藏小型猪骨髓间充质干细胞(MSCs)。分别用SPIO、CM-DiI及EGFP标记第3代MSCs,显微镜下观察标记后的形态,以及对细胞生物特性的影响；荧光显微镜及流式细胞仪检测传代前后不同代细胞标记率的变化。结果：25ug/ml铁浓度的SPIO标记第三代MSCs,经普鲁士蓝染色,细胞质内可见分布不同密度蓝色铁颗粒。随着培养时间延长,铁颗粒明显减少；CM-DiI在体外标记骨髓间充质干细胞荧光显微镜下呈红色,流式细胞检测标记效率98.0%,传代后P1、P2标记效率为分别为43%、18%,荧光强度也有一定程度降低,未见染料对细胞形态和生长产生明显影响：携带EGFP基因的慢病毒感染MSCs96h后,荧光显微镜下呈绿色,约84.5%细胞表达绿色荧光,体外培养传代培养,至第1、2代EGFP阳性细胞率为86%、86%,荧光强度基本保持不变,细胞生长不受病毒转染的影响。结论：SPIO、荧光染料CM-DiI及携带EGFP基因的慢病毒在体外均可标记西藏小型猪MSCs；三种标记方法在体外相比较,CM-DiI标记效率高,但稳定性较差,携带EGFP慢病毒感染标记相对稳定。