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将中药化学物质组学与系统生物学研究相结合,提出了中医药整体系统生物学,即“系统一系统”的研究体系,在此基础上,适应中医药临床研究和转换医学的需要,提出了以构建多层面生物标志物群为特征的临床系统生物学研究体系。以近年来开展的糖尿病肾病中医药临床系统生物学研究为例,提供了一套可量化的客观指标体系可以提高糖尿病肾病中医辨证分型的准确性和可信度,从整体水平展示了糖肾方的疗效特点。运用化学物质组学、血清药物化学、网络药理学和系统生物学等研究技术,系统阐述糖肾方的整体网络调控机制。