【摘 要】
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调节基因在植物的生长发育与环境适应中具有的重要作用引起广泛关注,但目前对直接参与植物逆境调控相关的转录因子的进化特征目前研究较少。ICE是CBF/DREB信号通路中的上游关
【机 构】
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中国科学院西北高原生物研究所高原生物进化与适应院重点实验室; 兰州大学干旱与草地生态学重点实验室分子生态研究中心; 中国科学院遗传与发育生物学研究所发育分子生物学院重点实验室;
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调节基因在植物的生长发育与环境适应中具有的重要作用引起广泛关注,但目前对直接参与植物逆境调控相关的转录因子的进化特征目前研究较少。ICE是CBF/DREB信号通路中的上游关键调控基因,在植物的冷信号应答中具有重要的作用。本研究应用同源克隆技术,对十字花科主要谱系分支的8个物种的ICE基因进行了克隆,结合GenBank中已有的c-MYC基因序列,对该基因家族的分子进化特征进行了系统发育分析,序列分析表明,ICE基因家族均具有保守的丝氨酸基序,bZIP碱性区和bHLH保守结构域。适应性进化分析发现,该基因家族在编码区存在明显的正选择位点;进化特征曲线分析表明,酸性区域存在的进化速率明显高于其它结构域的进化,正选择位点多数位于酸性区域。相对速率分析结果表明,穴丝芥分支的进化显著快于拟南芥分支。此外,对Cd-ICE组织特异性检测表明,该基因在不同组织中都表达。这些研究结果表明,ICE基因家族在进化过程中可能主要受纯选择作用,适应性位点的存在可能与松弛选择有关,ICE调控基因家族的分子进化特征,可能暗示其在低温调控方面存在差异,与十字花科植物在第四纪后期,占居多样的不利环境可能有关。
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