目的：食管癌癌前病变阶段,是食管癌发生之前的一个缓慢的、可逆的、多阶段的过程,历经不同程度的不典型增生.因此对这一阶段进行深入研究,进而找出有效的筛查和控制办法,将会大幅度的降低食管癌的发病率. 方法：应用包含6万个探针的表达谱芯片，分别检测了11例不典型增生患者的病变和远端(5cm)正常组织中mRNA的表达情况，及8例进展期食管鳞癌患者的病变和切缘组织中mRNA的表达情况;然后通过系统的生物信息分析手段筛选与食管鳞癌癌前病变阶段相关的基因，并对部分重要的候选基因进行蛋白水平的免疫组织化学验证。 结果：在全基因组水平筛选出食管鳞状细胞癌(ESCC)癌前病变阶段，特异相关(P＜0.05)的基因2409个，其中表达上调的有571个，表达下调的有1838个，分别涉及糖脂代谢、细胞周期调控及DNA损伤修复等通路。差异表达基因显著富集于TNF、ErbB、胰岛素受体等信号通路;同时发现，在食管鳞癌癌前病变阶段及进展期阶段都发生表达上调的基因9个，表达下调的基因68个。 结论：食管鳞状细胞癌癌前病变阶段可能影响机体的糖脂代谢、细胞周期调控、DNA损伤修复等多种机制;候选差异基因可能与食管癌的发生、发展整个过程相关。