【摘 要】
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基于基因电脑克隆软件SiClone和可变剪接分析软件AltSplice的并行优化工作,提出了一种基于大规模序列比对软件的并行优化方案.这种方案对所要进行比对分析的大规模序列库按照
【机 构】
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中国科学院计算机网络信息中心超级计算中心,北京,100080
【出 处】
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中国科学院计算技术研究所第八届计算机科学与技术研究生学术讨论会
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基于基因电脑克隆软件SiClone和可变剪接分析软件AltSplice的并行优化工作,提出了一种基于大规模序列比对软件的并行优化方案.这种方案对所要进行比对分析的大规模序列库按照某种策略进行分割部署,使机群中每个结点处理整个序列库的一部分,有效减少了磁盘I/O和结点间通讯开销,适合低价高效的Linux机群系统.
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