【摘 要】
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兔出血症(Rabbit Hemorrhagic Disease,RHD)是由兔出血症病毒(Rabbit Hemorrhagic Disease Virus,RHDV)所致的兔的一种急性、败血性、高度致死性传染病.该病于1984年发现,其
【机 构】
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南京农业大学动物医学院,农业部动物疫病诊断和免疫重点实验室,南京,210095
【出 处】
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中国畜牧兽医学会家畜传染病学分会第六届全国会员代表大会暨第11次学术研讨会
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兔出血症(Rabbit Hemorrhagic Disease,RHD)是由兔出血症病毒(Rabbit Hemorrhagic Disease Virus,RHDV)所致的兔的一种急性、败血性、高度致死性传染病.该病于1984年发现,其后在世界其它地区相继发生.迄今,国内外各养兔地区仍有存在或流行,是养兔业的严重威胁.
本研究用分子克隆技术从具有良好免疫原性的RHDV中国早期流行毒株NJ85中成功克隆病毒衣壳蛋白(VP60)全长基囚,序列测定该基囚长度为1740 nt,编码579 aa,并在GenBank注册(GenBank Accession AY269825).运用GenBank数据库、生物信息学和结构生物学方法,全面系统地分析了17年来世界各地RHDV毒株VP60基因的遗传变异,NJ85与WX84、TP二个中国毒株的VP60基因DNA序列的同源性分别为92.7﹪和97.2﹪,氨基酸序列的同源性分别为96.1﹪和98.6﹪,与其他国家16个毒株的VP60基因DNA序列的同源性在83.7﹪～97.0﹪之间,氨基酸序列的同源性在90.5﹪～99.0﹪之间,高度同源.进一步分析VP60基因的六个分区,A、B、D、F四个区变异率较低,C、E二个区变异率较高,表明A、B、D、F四个区较C、E二个区在病毒衣壳中执行着更多的生物学功能.在遗传进化上,历年来世界各地的RHDV毒株在氨基酸水平上可分为三个支谱系(群),在核苷酸水平上趋向四个支谱系,谱系没有呈现地理或时间特征.三个中国毒株分布在二个不同的支谱系中.与RHDV同为兔病毒属的欧洲野兔综合征病毒(EBHSV)组成了另一个谱系.以上结果对认识RHDV的变异趋势具有参考价值.分析了NJ85 VP60蛋白的分子量、等电点、疏水性、亲水性、抗原性、表面区、电荷、柔性区、二级和三级(立体)结构等分子结构特征.
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