全外显子组测序在单基因遗传病诊断中应用

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目的探讨全外显子组测序技术在单基因遗传病检测中的临床应用价值。方法对一青年男性疑似腓骨肌萎缩症患者采集外周血并提取DNA,进行全外显子组高通量测序。测序数据通过标准序列比对和数据库过滤等生物信息学分析,发现可疑致病突变,并对阳性结果进行突变位点验证。患者临床症状:下肢无力,步态异常13年,伴有足畸形、视力下降10年;下肢远端肌肉无力,萎缩,伴有马蹄形足;早发性青光眼。患者肌电图检测结果显示神经电图(NCV)肌电图(EMG)与原发性脱髓鞘的速率相吻合。尿中代谢物检测显示3-羟基丙酸、草酸、甘油酸、3-羟基戊二酸增加,提示营养障碍。SMN1基因检测未发现突变。结果对患者DNA进行全外显子组基因检测,结合临床诊断和实验室检查,评估后重点对以下临床表型相似的疾病进行分析:1.戊二酸尿症;2.巴特综合征(BTHS);3.腓骨肌萎缩症;4.结节性硬化症(TSC1;TSC2)。检测发现该患者SBF2基因纯合缺失,为临床意义明确的突变,可导致常染色体隐性遗传的腓骨肌萎缩症病4B2型,是一种脱髓鞘为特征的遗传性运动和感觉神经病,伴早发性青光眼,与患者临床表型相符。结论常规基因检测方法如Sanger测序,MLPA,核型分析等存在通量低、检测范围有限、检测精度不高等局限性,而生化指标和影像学检测无法为遗传学确诊提供依据。全外显子组测序通过对基因组绝大多数编码区检测和分析,可以通过一次检测同时分析同一疾病的多个基因或多种疾病的相关致病基因,可用于致病机制比较复杂的遗传病的检测以及单基因遗传病的鉴别诊断,能够有效地对临床使用常规方法难以诊断的遗传疾病提供分子水平的诊断依据。
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