进化分支节点距离法结合基因获得丢失检测大规模物种基因水平转移

来源 :中国植物病理学会2010年学术年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:duanluchao
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
基因水平转移(horizontal gene transfer,HGT),又称基因横向转移(lateral gene transfer,LGT),是指在差异生物个体之间,或单个细胞内部细胞器之间所进行的遗传物质的交流.差异生物个体可以是同种但含有不同的遗传信息的生物个体,也可以是远缘的,甚至没有亲缘关系的生物个体.基因水平转移是相对于基因垂直转移(亲代传递给子代)而提出的,它打破了亲缘关系的界限,使基因流动的可能变得更为复杂.细菌作为地球上存在时间最久且分布最广的一类生物,其进化历史一直在学术界备受争议.最近几年,随着分子生物学技术的发展,动植物病原菌的毒力以及大量耐抗生素的抗性基因的发现,主流的观点已经认为基因的水平转移是细菌进化的最主要动力.开发了一个新的方法用于检测不同物种间基因的水平转移,通过比较基因的进化树与物种的进化树,分析进化分支节点的变化,并利用bootstrap抽样方法确定水平转移基因变化的阈值,最终确定水平转移的基因以及其供体和受体物种。新的方法不仅能快速的分析大量多物种的基因进化树同时也考虑到了不同进化树构建方法带来的差异,在进行确定水平转移基因时过滤不同进化树构建方法存在较大差异的物种基因。
其他文献
《语文课程标准》指出:“培养学生广泛的阅读兴趣,扩大阅读面,增强阅读量,提倡少做题,多读书,好读书,读好书,读整本的书.”因此,必须激发学生语文阅读的热情,培养学生语文阅
购物是我们生活中平常不过的事情。然而,对工作繁忙的都市白领和行动不便的老人而言,购物有时却是难题。如何解决这个难题呢? 在星城长沙,有一位名叫国小琳的打工妹,正是从
情境、结构及交际混合法的本质在于语言学习者不仅要将运用语言作为目标,而且还要把语言作为一种能获取具有独立意义成果的手段.如何运用情境、结构及交际混合法来打造我们的
柑橘黄龙病(Citrus Huanglongbing)是柑橘生产上的一种毁灭性病害,最早在我国广东省潮汕地区发现,至今已有100多年的历史.本研究通过对柑橘黄龙病菌亚洲种“Ca.L.asiaticus"
会议
2003年以来,全国各地纷纷传来高级技工告急的消息。北京市公布的月薪超过5000元的十大急需职位中,高级技工就占了4位。青岛市一家塑料制品公司更是开出年薪16万元天价,急招一
  Abstract Xylella fastidiosa is the causative agent of many economically important plant diseases.Genetic diversity of X.fastidiosa provided a framework to d
会议
现在,我们一般人的身体都缺乏适量运动,所以更应该通过卓有成效的运动方式来把身体调理好。但“没时间锻炼”和锻炼后效果不明显的原因把很多人锻炼身体的信心减弱了,在这里,
在寒冷的冬季,患有关节炎病变的老人会感到很不舒服,甚至关节炎有加重的迹象。据骨科专家介绍,在这个季节到骨科就诊的患者会超出平时的一倍,许多上年纪的老人都患有关节疾病
P.syringae pv.syringae的寄主范围很广,其中包括禾本科的水稻,引起水稻细菌性褐斑病,病斑主要发生在叶片上,叶鞘、穗茎及谷粒均可受害.目前国内对于该病菌的研究大多是针对
会议
我们这些从农村入伍的战士,很少看到(几乎没有)反映工农子弟在部队火热生活的影片。部队工农子弟的成份占百分之八、九十,中国这么多个制片厂,这么多的编剧、导演同志,为什