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目前认为针刺信号与痛觉信号在各级水平中枢神经系统相互整合是针刺镇痛的神经生化、神经生理机制。针刺能使感受器发送神经冲动通过脊髓以及上行途径到达大脑引起神经递质的释放，在中枢水平进行调制，以阿片肽为代表的内源性痛觉调制系统在针刺镇痛过程中发挥重要作用。韩济生等的研究结果为此理论提供了可靠的证据。他们证实在针刺人体穴位后，能产生不同程度的镇痛作用，而后又进行了脑脊液交叉灌注的动物实验，将针刺镇痛家兔的脑内脑脊液引出，注入另一家兔脑内，发现后者产生明显的镇痛效应。本文主要就针刺镇痛效应与穴位局部结构的关系展开了详尽的论述。