基于16SrRNA高通量测序技术分析不同地区东北酸菜细菌群落结构

来源 :中国食品科学技术学会第十五届年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:war_and
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  为探究不同产地东北酸菜中细菌群落多样性,本研究采用Illumina HiSeq 测序平台对东北三省不同城市所采集酸菜样品中细菌16S rRNA 基因的V3-V4 区进行测序,结果表明:根据样品群落Alpha 多样性评价发现,吉林地区酸菜样品中细菌群落的Shannon 指数最高,Simpson 指数最低,表明该地区酸菜中细菌菌落的多样性最高,Beta 多样性分析发现东北三省的酸菜中存在相似细菌菌落结构;通过物种丰富度分析,东北三个地区酸菜中检测到细菌优势菌门为Firmicutess、Cyanobactoria、Proteobacteria、Bacteroidetes、Actinobacteria,其中Actinobacteria 仅存在于吉林地区样品中;细菌的优势菌属为Lactobacillus、Pediococcus、Unclassified、Leuconostoc、Bacteroides、Lachnospiraceae NK4A136 group、uncultured bacterium、Enterobacter.其中黑龙江地区的酸菜中Lactobacillus 最高,辽宁地区酸菜样品中Unclassified 含量较高;黑龙江地区酸菜样品中Pediococcus 的含量较低,而吉林和辽宁地区的酸菜样品中Pediococcus 的含量相当;最后,通过理化指标与细菌群落结构的相关性进行分析发现,理化性质与细菌群落结构之间存在较大的相关性,其中盐度、pH 和总酸度对细菌菌落结构多样性影响较大.
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