利用双向蛋白电泳(2-DE)和质谱(MALDI-TOF-MS)技术对优质面条小麦品种豫农201及其EMS突变体豫农3114不同发育时期种子进行蛋白组学研究,共鉴定出130个差异蛋白点,属于88个独立蛋白,可归纳为四种不同种子发育中后期的动态表达模式。鉴定的蛋白点共涉及8种生化途径:逆境胁迫、碳代谢、蛋白合成降解、储藏蛋白、能量代谢、光合作用、转录翻译和信号转导。进一步对两个品种间差异蛋白质组研究表明,有12个蛋白点以不同的表达模式在两个小麦品种中呈现共积累,而有6个蛋白点在各个时期品种间均表现出较大差异,其分别为丝氨酸蛋白酶抑制剂、α淀粉酶抑制剂前体、小热激蛋白、α-淀粉酶抑制剂、β-淀粉酶和冷调控蛋白。由于豫农201和豫农3114之前具有显著不同的抗逆性和籽粒大小差异,这6个品种间差异蛋白点可能是造成两个小麦品种抗逆性和籽粒大小差异的重要原因。这项研究为我国小麦产量相关性状的生化和分子遗传学基础研究提供了重要信息,同时蛋白质水平的特征分析为种子发育中后期的生物学特性提供新见解。