【摘 要】
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目的:利用全基因组芯片基于GO分析技术筛选小鼠牙根/牙周的前体组织——牙囊组织发育不同时期的差异表达基因。方法:以激光显微切割技术获取胚胎17天(Embryonic 17,E17)和出
【机 构】
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解放军第306医院; 首都医科大学口腔医学院; 韩国延世大学口腔医学院;
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目的:利用全基因组芯片基于GO分析技术筛选小鼠牙根/牙周的前体组织——牙囊组织发育不同时期的差异表达基因。方法:以激光显微切割技术获取胚胎17天(Embryonic 17,E17)和出生后2天(Postnatal 2,PN2)两个时期小鼠下颌第一磨牙的牙囊组织,以改良Trizol法提取总RNA。取经检纯度及完整度都合格的RNA样品,合成cRNA,再以Aglient小鼠全基因组表达芯片对比筛选上述两时期差异表达基因。所获得的原始数据以GeneSpringGX 7.3进行归一化及倍数筛选,以BioCarta,GenMAPP软件进行基因分类和GO分析。结果:1、得到在两个发育时期牙囊组织相对于牙乳头组织表达倍数都在10倍以上的基因,此基因列表为今后筛选出牙囊特异表达标志物提供了一定范围。2、得到细胞外基质等十余项常见生物功能相关的两时期对比差异基因列表。结论:将激光显微切割以及基因表达芯片两种技术联合应用于以小鼠为动物模型的牙周组织发育研究,筛选出发育过程中差异表达基因的技术路线是可行的。
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