牛荚膜A型巴氏杆菌多重耐药株全基因组测序及耐药基因筛选

来源 :中国畜牧兽医学会兽医药理毒理学分会第十一届会员代表大会暨第十三次学术讨论会与中国毒理学会兽医毒理专业委员会第五次学术研讨 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zhengzheng369
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  [目的]本实验旨在对临床分离的牛源荚膜A型巴氏杆菌多重耐药株Pm-3进行全基因组序列测定,并对其携带的耐药基因进行挖掘定位,以期为牛源荚膜A型巴氏杆菌耐药机制的深入研究奠定基础。[方法]利用Pm种特异性及荚膜血清特异性引物对菌株进行鉴定分型,并采用琼脂稀释法测定8种临床常用药物对其最低抑菌浓度(MIC);通过Illumina Hiseq2000平台对受试菌株进行全基因组测序。[结果]受试菌株Pm-3鉴定为牛荚膜A型巴氏杆菌,其对新诺明,阿米卡星,青霉素呈高度耐药。经全基因组测序Pm-3菌株共获得了452 Mb数据,经过测序组装,得到大小为2,443,368 bp的基因组。对所测数据进行了GO数据库、KEGG数据库功能注释,并进行了ARDR耐药数据库分析,共筛选到10个与耐药相关基因。[结论]受试菌株为多重耐药的牛源荚膜血清A型巴氏杆菌,且其基因组中携带有介导青霉素,磺胺类耐药及介导喹诺酮,大环内酯类主动外排的耐药基因。
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