城市河流受工业污水和生活污水影响出现黑臭现象,影响城市的可持续发展。水体中多环芳烃(PAHs)、邻苯二甲酸酯(PAEs)等有机污染物因其疏水性容易吸附在悬浮颗粒物上,经沉降富集在沉积物中。但城市河流沉积物PAEs和PAHs污染特征及其底泥生态功能的影响鲜见报道。本研究选择广州市6条黑臭水体河涌采集的沉积物样品,分析了PAHs和PAEs的污染特征以及其与N、P、S循环相关基因环境丰度的关联性,以揭示该环境下污染物的发生对相关生态功能造成的潜在影响。结果表明,邻苯二甲酸二(2-乙基)己酯(DEHP)、荷(Flu)、苯并(k)荧蒽(BkF)、苯并[a]芘(BaP)检出率为100%,邻苯二甲酸二(2-乙基)己酯(DEHP)、芘(Pyr)检出浓度最高,分别为307-13829、nd-881μg/kg (干重)。本次调查的河涌底泥中PAHs、PAEs的污染水平总体上比其它区域河流或湖泊底泥的高。严重黑臭水体的底泥中PAEs和PAHs的污染水平高于轻度黑臭水体,并且PAHs在不同程度黑臭水体底泥的污染差异比PAEs显著。不同程度黑臭水体的河涌底泥中N、P、S循环相关基因的丰度存在差异,随着水体黑臭程度的加重其N、P相关基因丰度降低。结果说明污染物潜在地降低了N、P循环中微生物的介导作用,而S相关基因丰度的升高加重水体的黑臭。PAHs降解相关基因与污染物呈显著正相关,说明PAHs的污染水平潜在趋化了微生物对其降解功能。冗余分析表明,PAHs和PAEs对相关功能基因丰度的影响贡献大于总有机碳、总氮等环境因子。因此,污染物对河流沉积物生态功能的损伤应引起重视。