许多天然蛋白质分子能够自发折叠到其天然态结构,而有些蛋白质分子的正确折叠需要分子伴侣的协助。然而分子伴侣协助蛋白质分子折叠机制仍不十分清楚。蛋白质分子序列决定其折叠路径和结构,而半柔性均聚物如何折叠以及其与蛋白质分子折叠行为的差异需进一步阐明。本论文我们主要开展两个方面的工作:(1)分子伴侣素对一些折叠受挫蛋白质分子折叠行为的影响;(2)半柔性均聚物折叠热力学和动力学行为。(1)本章使用db模型和db+MJh?模型对比地研究了不同受限腔尺寸下蛋白质分子Im7,Im9与A39V/N53P/V55L Fyn SH3结构域蛋白的折叠行为。随着受限腔尺寸的减小,非自然态疏水相互作用增强,尤其在解折叠态更为明显。强的非自然态疏水相互作用导致解折叠态稳定性升高。在简单受限时采用db+MJh?模型时稳定性与速率增加程度均小于使用db模型得到的结果,特别是Im7,在零变性剂浓度条件下,受限作用还会使其折叠速率降低。错误折叠中间体含量随着受限尺寸的减小而增加。若底物蛋白与受限腔之间存在相互作用,三条蛋白的折叠稳定性均会随相互吸引作用的增强而减小。折叠速率也与吸引相互作用强度相关。空间受限以及与受限腔之间的吸引作用均能改变折叠路径分配。本章的研究结果有助于深入理解受挫小蛋白在分子伴侣协助下的折叠过程。(2)运用郎之万动力学方法系统探索了半柔性均聚物的热力学及动力学行为。与实验结果相符,热力学状态图中可观察到丰富的共存态结构。由于折叠中间态稳定性随着温度的降低而增大,导致chevron图的折叠臂出现明显的翻转。半柔性高分子折叠沿着多种塌缩路径,且可被溶剂质量调节。此外,我们发现半柔性高分子链打结主要遵循插入、滑结与滑移三种机制。该研究结果对理解蛋白质分子折叠的一般机制具有重要作用。