人类的新发传染病多数是由动物向人传播的病原体引起的。在人群中导致传染病高爆发与大流行的病原体，往往很少或者不会在其自然宿主中引起临床症状，而此类病原蔓延到人类，则对人类健康和全球经济造成巨大的影响。因此，揭示重要自然宿主携带的病原的多样性，阐明在公共卫生领域有潜在重要影响的新型病原体，可以为相应新发传染病的预防提供直接的科学数据。树鼩具有特殊的遗传演化地位，已有研究表明，树鼩携带多种病毒，如单纯疱疹病毒、柯萨奇病毒、乳头瘤病毒等。不过，树鼩携带的病毒多样性没有得到全部揭示。
　　本研究通过病毒宏基因组学方法，调查了中国树鼩携带的病毒多样性，对6种内脏组织样品和肛咽拭子样品分别进行病毒宏基因组学研究，结合高通量测序，共发现了56个病毒科的病毒，其中包括30个科的动物病毒。结果表明树鼩携带的病毒多样性高，包含多种重要动物病毒病原。采用PCR检测方法对七种不同病毒科的病毒进行了流行病学调查，结果显示细小病毒(parvovirus )、腺病毒(adenovirus)、细环病毒(torque teno virus)、肝炎病毒(hepacivirus)、戊型肝炎病毒(hepatitis E virus )、副黏病毒(paramyxovirus )、肺炎病毒(pneumovirus )等七种病毒在树鼩中普遍存在，且有多种病毒为新型病毒。接着对部分病毒株展开了全基因组序列鉴定和遗传分析，发现一株树鼩肺炎病毒与猪肺炎病毒具有极高的相似性，全基因组核苷酸相似性98.451%，二者具有较近的分化时间，意味着此病毒在两种宿主之间可能存在跨种传播。
　　本研究结果提示树鼩携带多种新型病毒，且少数病毒有种间传播的可能，有必要继续加强对树鼩病毒的调查研究。