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目的：研究6例Gleevec靶向治疗耐药GIST的临床病理、蛋白表达、超微结构和分子生物学特征，与100例原发性GIST对照，找寻GIST耐药的发生机制。
方法：采用免疫组化、电镜和聚合酶链反应(PCR)及基因测序的方法，检测100例原发性GIST和6例Gleevec靶向治疗耐药GIST蛋白(CD117、CD34、nestin、α-SMA、desmin和 S-100)表达、超微结构和基因突变(c-kit基因和PDGFRa基因)情况。6例耐药患者在Gleevec治疗前后共行20次手术治疗的标本均进行了形态学、免疫组化和基因突变筛查。其中Gleevec治疗前11次，Gleevec治疗15天后1次，Geevec耐药后共8次(其中2位患者发生2次耐药)。采用SPSS统计学方法分析原发性GIST中免疫组化的表达、基因突变与临床病理，生物学行为的关系。比较原发性GIST与耐药GIST在免疫组化、超微结构和基因突变方式上的改变。
结果：
1、免疫组化检测显示：100例原发性GIST中CD117、CD34和nestin的阳性率分别为97.0％、78.0％和94.0％，多为弥漫强阳性，均定位于细胞浆。α-SMA和S-100的阳性率较低，分别为26.0％和24.0％，多为局灶阳性。desmin仅2例局灶阳性。6例耐药患者原发肿瘤组织弥漫强表达CD117，复发或转移后CD117表达有所下降，首次耐药后CD117重新弥漫强阳性表达至第二次耐药后表达再次下降。6例原发肿瘤组织中CD117的表达均位于细胞浆，耐药后5例出现核旁点状阳性的表达现象。
2、超微结构显示：15例原发性GIST瘤细胞含丰富的线粒体，粗面内质网、游离核糖体和中间丝较多见，质膜处偶尔分布一些微饮泡、密斑样结构和不连续基板，部分病例可见多量细长指状突起，未见明显的平滑肌和神经分化特征。。而耐药GIST 细胞器更丰富，膜性结构易见，细胞核形态怪异。
3、基因突变检测显示：100例原发性GIST的基因突变主要发生在c-kit基因的11外显子(75.5％)，主要集中在550～576位点，以缺失和点突变为主要方式，偶可见重复和插入。9外显子突变率为(5.1％)，突变方式恒定，为ins AY502503；没有检测到13、17外显子的突变。PDGFRα基因18外显子突变率为(3.1％)，未检测到PDGFRα基因12外显子突变。耐药GIST在原突变的基础上，均发生了二次突变，突变位置为c-kit基因17外显子(83.3％，5/6)和13外显子(16.7％，1/6)。
结论： GIST主要表达CD117，CD34和nestin。耐药后GIST c-kit蛋白表达定位发生了改变。超微结构与ICC细胞相似，缺乏明显的平滑肌和神经分化特征。c-kit基因及：PDGFRα的突变与部分GIST肿瘤发生密切相关。耐药后GIST均检测到了二次突变，可能与耐药的发生有关。