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目的:本研究以第10号染色体同源丢失性磷酸酶-张力蛋白基因(phosphatase and tensin homology deleted on cnhromosome 10,PTEN)为候选基因,筛查分析江西地区HBV相关肝癌患者,探讨PTEN基因是否与HBV相关肝癌发病有关及同其临床表型的关系。方法:收集60例HBV相关肝癌患者(Hepatocellular carcinoma,HCC组)、70例慢性乙型病毒性肝炎患者(Chronic Viral Hepatitis B,CH-B组)、135例正常对照(Control,C组)外周血标本,通过候选基因和DNA直接测序法,对PTEN基因外显子和内含子区进行DNA测序筛查,寻找基因突变及多态性并进行肝癌关联分析。Hardy-Weinberg平衡检验、各组间基因型、等位基因及单体型频率比较采用χ2或Fisher精确概率法计算;相对风险度计算采用非条件logistic回归分析。结果:HCC组患者PTEN基因未发现突变,但在其DNA序列上发现4个多态性,即Ala34Cys、leu57phe、IVS8+G32T和T2281G。随后我们选取常见的基因多态性(频率>5%)并可能影响其表达的Ala34Cys和IVS8+G32T位点进行研究。基因分型显示,Ala34Cys多态性只检测到GC/GC和GC/TG两种基因型,未发现TG/TG基因型;IVS8+G32T则存在G/G、G/T、T/T三种基因型。两位点各基因型频率及等位基因频率分布在HCC组、CH-B组及正常对照组之间均无统计学差异。对Ala34Cys和IVS8+G32T进行单体型构建发现存在GCG、GCT、TGT、TGG等4种单体型,χ2检验发现HCC组同正常对照组相比,GCG单体型分布存在显著差异(χ2=4.78,P=0.03),logistic回归分析显示GCG单体型携带者较非GCG单体型携带者发生肝癌的风险明显减小(OR=0.62,95%CI为0.40-0.95),其余3种单体型未发现显著差异。分析发现各基因型、等位基因及单体型分布频率同HBV相关肝癌临床病理指标包括血清甲胎蛋白(AFP)、合并肝硬化、肿瘤病理分级、数目、大小、TNM分期以及转移等无显著差异,但对基因型分布频率比较发现携带Ala34Cys GC/GC基因型和IVS8+G32T T等位基因者较GC/TG和G等位基因者在AFP≥400 ug/L(分别为70.2%vs29.8%和55.3%vs44.7%)、合并肝硬化(分别为77.8%vs22.2%和55.6%vs44.4%)、中低分化(分别为78.6%vs21.4%和60.7%vs39.3%)、肿瘤直径≥5cm(分别为71.8%vs28.2%和57.7%vs42.3%)、多发(分别为79.2%vs20.8%和61.4%vs38.6%)、TNM分期III + IV(分别为70.0%vs30.0%和60.0%vs40.0%)及转移(分别为82.4%vs17.6%和55.8%vs44.2%)中所占比例较高。结论:1.在PTEN基因中发现Ala34Cys、leu57phe、IVS8+G32T和T2281G等4个多态性,其中Ala34Cys、leu57phe和T2281G为首次发现。2.PTEN基因Ala34Cys和IVS8+G32T多态性在江西人群HBV相关肝细胞肝癌发生过程中可能存在交互效应,携带GCG单体型对于HBV相关肝癌发生具有保护作用。3.PTEN基因突变与江西地区HBV相关肝细胞肝癌可能无关。