天津地区猪繁殖与呼吸综合征病毒分离鉴定及遗传演化分析

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猪繁殖与呼吸综合征在众多的养猪国家大规模流行,是当下养猪行业中极其重要的传染性疾病之一。临床症状主要为母猪的死胎、早产和流产;仔猪在断奶保育阶段以咳嗽和呼吸困难等呼吸道症状为主。由于PRRSV在流行过程中存在不断的遗传变异,以及疫苗不能发挥良好的保护效果,因此对PRRSV的流行进行监测和遗传演化分析是非常重要的。本研究采用ELISA的方法对样品开展血清学检测,结果表明天津地区免疫猪群的PRRSV的抗体阳性检出率为79.29%,未免猪群的抗体阳性检出率为25.63%。此外,利用鉴别RT-PCR对样品开展分子流行病学调查,结果显示平均检出率为40.47%,并且呈现增长趋势。类NADC30的检出率为28.74%,占整个阳性样品的71.01%。同时研究了PRRSV与其他病毒和细菌的混合感染情况。针对PRRSV的ORF5和Nsp2高变区,对检测样品进行序列测定。利用Marc-145细胞和PAMs细胞,结合CPE、RT-PCR和免疫荧光,对PRRSV优势毒株进行分离纯化鉴定,并对其全基因组序列进行测定和遗传演化分析。ORF5的遗传演化分析发现,TJjh1602等12株类NADC30毒株在ORF5的34位缺失了一个氨基酸。Nsp2遗传演化分析发现,有48株与NADC30毒株氨基酸有着相同类型的“111+1+19”的缺失模式,并且存在不同的点缺失。分离毒株TJxq1701和TJjh1602的全基因组遗传演化分析表明,TJxq1701毒株位于HP-PRRSV毒株的分支,TJjh1602与类NADC30毒株位于同一分枝。综上所述,PRRSV在天津各地区均有流行,类NADC30毒株已经成为主要流行毒株,并且在流行过程中还在不断的发生变异。成功分离鉴定了一株类NADC30毒株TJjh1602。全基因对比发现,在ORF5的34位缺失一个氨基酸,其生物学意义有待进一步研究。
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