论文部分内容阅读
建立基因敲除的细胞系对揭示基因功能非常重要,发现DNA结合蛋白对研究基因的稳定性和表达调控也有非常重要的意义。在本文第一部分中我们利用CRISPR/Cas9技术成功构建了胰腺导管腺癌细胞系AsPC-1敲除PRNP的细胞模型,这将对PRNP的基因功能研究提供宝贵的科研材料。论文的第二部分中,我们结合BioID技术和CRISPR/Cas9创造性地提出了一种发现DNA结合蛋白质的新方法:CRIPSR-BioID。通过共表达内切酶活性丧失的dCas9与生物素连接酶birA的融合蛋白以及向导RNA(gRNA),融合蛋白在向导RNA的引导下识别指定的内源基因组DNA,通过birA将外源提供的生物素标记到DNA附近的蛋白质上。利用链霉亲和素的琼脂糖珠可将生物素化的蛋白质富集,通过质谱分析,即可将这些蛋白鉴定出来。 结果表明,dCas9-birA-NLS1-HA融合蛋白具有核分布、生物素化催化活性以及RNA指导的DNA结合活性。当向共表达向导RNA和该融合蛋白的细胞提供生物素时,该融合蛋白在靶向端粒的向导RNA指导下,可以有效的将端粒结合蛋白成功标记上。但是,该方法仍然存在不足,文中提出了若干可能的解决思路,后续工作正在进行。该研究提出了大规模、快速发现DNA结合蛋白的新思路,将对研究染色质的结构和遗传信息的调控起到推动作用。