胡萝卜（Daucus carota L.）在冬春大棚栽培和早春露地栽培时，易受低温和长日照影响发生先期抽薹，抽薹植株的肉质根膨大受到抑制并迅速木质化，造成减产。目前先期抽薹已经成为生产上的―瓶颈‖问题，而市场上适宜春播的耐抽薹胡萝卜品种短缺，因此，了解胡萝卜抽薹调控机理，有助于耐抽薹品种的选育。本研究以松滋‘野生胡萝卜（P1）和栽培种Amsterdam‘（P4）为试材，通过对种根和幼苗进行低温和遮光处理，证明低温春化是胡萝卜发生抽薹的必要条件，长日照对抽薹的启动有显著的促进作用。利用Solexa测序技术构建了包含76997条unigenes的转录基因数据库，平均长度666bp，获得47796条注释基因。通过与拟南芥成花调控基因比对筛选了47条的候选基因并包括光周期途径关键基因GI、COL，春化途径上的FRI、FLC，成花信号整合因子SOC1等，对22条进行了PCR验证，有17条扩增出预期产物，4对引物产物在品种间存在多态性。对胡萝卜中的3个FLC同源基因深入分析，该基因与木本植物进化关系较近，qPCR结果显示DcFLC1和DcFLC3受低温诱导表达，光照对DcFLC2影响较大，另外DcFLC3在耐抽薹的P4中特异表达，并在胡萝卜种质资源中呈现多态性，可能与品种的低温敏感性有关。