辣椒溶杆菌X2-3缬氨酸-甘氨酸重复蛋白VgrG基因功能分析

来源 :山东农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:schunter
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
生防细菌可以促进植物的生长发育、产生多种代谢产物进而发挥拮抗性或竞争性作用,抑制或杀死病原菌,是植物病害生物防治的重要资源。植物根际促生细菌(Plant Growth Promoting Bacteria,PGPB)的定殖能力、抗菌活性、环境耐受性等是其发挥作用的前提。辣椒溶杆菌X2-3是从小麦根际土壤中分离的对多种植物病原真菌和卵菌具有明显拮抗活性的菌株,具有良好的生防潜能,但目前尚未有一种适用于菌株X2-3的基因敲除技术。本研究利用自杀载体,建立了一种适用于L.capsici X2-3菌株的基因定向敲除技术,对基因VgrG进行敲除,分析了突变体在生物学特性、竞争性及环境耐受性等方面的特征,为以后深入挖掘X2-3的功能及应用奠定了基础。本研究的研究结果主要包括以下方面:  1.基因LC1470序列分析及功能预测  根据X2-3全基因组测序和功能预测结果,编号LC1470的基因可能编码VI型分泌系统Vgr家族的保守蛋白。经GenBank,Blastp对比,发现LC1470与L.antibioticus、L.capsici VgrG基因氨基酸的同源性达到了96.35%,具有高度保守性。  2.VgrG基因敲除突变体及基因互补突变株的获得  根据基因序列设计特异性引物扩增基因VgrG的同源臂,并将其与自杀载体pKMS1连接,成功构建pKMS1-VgrG敲除重组载体。电击转化野生菌株X2-3感受态细胞,经卡那霉素(Km500μg.mL-1)和10%的蔗糖平板NAS筛选,初步得到VgrG缺失突变体。经PCR和Southern blot验证,确认菌株M651为VgrG基因缺失突变株。  以野生株X2-3的基因组DNA为模板,设计特异性引物,扩增LC1470的完整ORF;经HindⅢ和BamH I双酶切后,连接到同样双酶切的广宿主载体pBBR1-MCS5。将重组质粒pBBR1-1470转入突变菌株M651的感受态,经表型观察和PCR验证,获得互补株MCS18。  3.野生株、突变体生物学特性分析  对野生株、突变体M651和互补菌株MCS18的菌落形态比较发现:野生菌株X2-3表面光滑、粘稠,而突变菌株M651表面多褶皱、粘度低,而互补株MCS18恢复了野生型菌株的形态。突变菌株M651的生长速度,在测定的各时间点均明显低于野生菌株X2-3,互补株MCS18基本恢复野生株水平,但在个别时间点上与野生株也有显著差异。  从生物膜产量、胞外多糖产量和运动能力等方面,对突变体与野生株的生物学特性进行分析。结果发现野生菌株X2-3的生物膜产量显著高于突变株M651,互补菌株MCS18的生物膜产量低于野生株,但是两者间没有显著差异。对胞外多糖测定发现,突变菌株M651的胞外多糖产量显著高于野生株和互补菌株MCS18。突变株M651的运动能力显著低于野生菌株X2-3,互补株MCS18的运动能力基本恢复到了野生株的水平,与野生株无显著性差异。平板对峙法对菌株的抑菌活性分析发现,野生菌株X2-3、突变株M651、互补株MCS18的抑菌活性没有显著的变化。  4.野生株、突变体抗逆性分析  从温度、SDS、酸碱度、盐浓度、紫外线等分析了各菌株的抗逆能力。结果发现突变菌株M651对高低温度、酸碱度、盐浓度、SDS的耐受性显著低于野生菌株,互补株MCS18与野生株的耐受性也存在一定差异,但差异并不显著。突变株M651、野生株X2-3和互补株MCS18对紫外线处理均不敏感。这些结果表明,基因VgrG不仅会影响菌株的生物学性状,还与菌株对环境的耐受性有关。  5.野生株、突变体与其它细菌的竞争能力分析  选择烟草青枯菌(Ralstonia solanacearum)、植物根际细菌(Burkholderia cenocepacia)D-7和Escherichia coli S17-1为靶标,对野生菌株X2-3、突变株M651及互补菌株MCS18的竞争能力进行分析。通过平板计数法和实时荧光定量PCR(Quantitative Real-time PCR,qRT-PCR)法,分析了突变体与野生株竞争能力是否存在差异。平板计数法测定发现,突变菌株M651对R.solanacearum、E.coli S17-1和B.cenocepacia D-7竞争能力与野生株相比均有不同程度的减弱,而互补菌株MCS18的竞争能力基本恢复野生株的水平。  进一步用qRT-PCR法分析发现,与E.coli S17-1、B.cenocepacia D-7和R.solanacearum共培养后,突变菌株M651的浓度比在24h、48h分别为12.57%和13.81%、10.68%和18.27%、1.59%和2.08%,均低于野生菌株X2-3、互补菌株MCS18的比值,这表明突变菌株M651对E.coli S17-1、B.cenocepacia strain D-7、R.solanacearum的竞争作用弱于野生菌X2-3和互补菌株MCS18。
其他文献
目的:探讨异位妊娠的早期超声诊断.方法:对我院2015年1月—2017年12月期间收治的异位妊娠患者80例的临床资料及声像图表现进行分析.结果:声像图特征为宫腔内无胎囊回声,宫腔
现代生活中民间文化的重要性已受到了较大忽视,民间文学也因此面临着消逝的危机,保护和传承民间文学对我国民族遗产和社会研究都有着重要作用.以“旁(竾)”为主人翁的民间故
目的:分析评价中医治疗咳嗽变异型哮喘的临床疗效.方法:随机抽调60例咳嗽变异型哮喘患者进行研究,均分为两组,对照组30例用常规西医治疗,观察组30例在对照组治疗基础上结合天
变电站继电保护主要用在出现故障时及时断开设备,以减轻或避免设备的损坏和对相邻地区供电的影响,提高整个电力系统的稳定性和可靠性。但是在有的时候,由于受到不同方面的影响,导
目的:了解氨氯地平阿托伐他汀钙片治疗高血压合并冠心病患者的临床疗效.方法:以随机法将2014年1月—2017年1月本院收治的200例高血压合并冠心病患者分成两组:100例予以阿托伐
目的:探析早期精神分裂症采取奥氮平与齐拉西酮治疗的临床效果.方法:将2014年8月至2017年8月我院诊断确诊为早期精神分裂症患者88例作为研究对象,随机均分成参照组与干预组,
目的:探究高压氧联合输液在治理突发性耳聋的临床效果,并评估其安全性.方法:对我院收治的37例突发性耳聋患者按意愿进行分组,分别给予高压氧联合输液及传统输液处置,观察其临
随着我国经济社会的不断发展,我国机械热加工强化技术也在不断发展。机械热加工强化技术的应用范围十分广泛,在建筑工程、化学工业等等各个领域都有所涉及,在航空领域中,对该技术
黄顶菊Flaveria bidentis (L.) Kuntze原产于南美洲,大约于上世纪90年代传入我国,截至2007年底,仅河北省的黄顶菊疫情已扩大到11地市89县(区、市),严重危害面积达56万多亩,呈
目的:对比并探究热牙胶垂直加热与冷侧方加压治疗慢性牙髓炎、根尖周炎的临床效果.方法:本次研究对象为180例慢性牙髓炎、根尖周炎患者,将其随机分成观察组和对照组,各90例.