新经济是以高新技术尤其是计算机网络技术、生物工程技术、新材料技术、航空航天技术为基础引发的新的经济增长模式和新的经济运行变革。事实表明企业广义上的无形资源正推动着企业自身的飞速发展,企业市场价值与其账面价值之间差距也越来越大,创造企业价值的因素也随之发生了很大变化。新经济中的重要角色——高新技术企业,如何把握好这个发展机会发掘影响企业价值的潜在因素,提升自身价值,意义就显得尤为突出。基于以上背景和企业价值相关理论,在深入和细化研究现阶段我国高新技术企业价值与其非财务影响因素之间的相关关系的基础上,从现阶段高新技术企业的技术创新能力、风险因素、机会价值、人力资源综合效能以及公司治理效率五个重要非财务影响因素入手,选取了2006年电子制造业、有色金属、生物制药业、化学工艺和信息技术业等五个行业的高新技术上市公司为样本,运用结构方程模型的实证研究方法,分析高新技术企业价值与其非财务影响因素之间的相互关系。实证分析的结果一方面验证了原先的假设,得出的结论有些与国内外文献研究结论一致,但同时也发现了一些可喜的新结论:技术创新能力、机会价值、人力资源综合效能、公司治理效率与企业价值正相关,风险因素与企业价值负相关,其中技术创新能力对企业价值的影响能力最大,风险因素次之。文章最后根据研究结果,从影响高新技术企业价值的非财务因素出发,对提升我国高新技术企业价值提出了相关政策建议,这可以帮助高新技术企业更好的认识自身的价值及其提升途径,并以此为根据设计或修正自己的理财行为,使企业财务管理目标得以更好地实现,同时对高新技术企业价值评估研究,以及促进我国高新技术企业健康、快速发展具有非常重要的意义。