【摘 要】
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牙周病的发病广泛,可以破坏牙周组织造成崩解性的牙周病变,且与多种系统性疾病相关。传统的病因学认为细菌是牙周病的主要致病因素,但是该理论并不能完整解释牙周病的所有临床症状。近年来病毒作为牙周病致病因素的研究逐渐受到关注,相关的研究证据甚至可能彻底颠覆目前对于牙周疾病的诊断、预防以及治疗策略。但牙周环境内的病毒群落复杂,传统的病毒鉴定技术需要依赖于培养及已知序列,均存在各种局限性,已不能满足环境内病毒
【基金项目】
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国家自然基金面上项目（81470737）；
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牙周病的发病广泛,可以破坏牙周组织造成崩解性的牙周病变,且与多种系统性疾病相关。传统的病因学认为细菌是牙周病的主要致病因素,但是该理论并不能完整解释牙周病的所有临床症状。近年来病毒作为牙周病致病因素的研究逐渐受到关注,相关的研究证据甚至可能彻底颠覆目前对于牙周疾病的诊断、预防以及治疗策略。但牙周环境内的病毒群落复杂,传统的病毒鉴定技术需要依赖于培养及已知序列,均存在各种局限性,已不能满足环境内病毒群落研究的需要。而病毒宏基因组学作为一项新兴技术,能充分挖掘特定环境中的病毒群落和新发病毒,已在各领域展现出独特的优势。本课题综合应用了病毒宏基因组学、高通量测序及生物信息学等技术,对于30份合并的慢性牙周炎患者牙菌斑内的病毒群落及滴度进行了深度分析。经过比对分析,初步勾勒出了慢性牙周炎患者牙周环境内病毒群落,证实该群体牙菌斑中的病毒是以双链DNA病毒为主,大部分的病毒序列可以匹配到双链DNA病毒家族中的Human Herpes Virus（13/30）、Taterpox virus（11/30）、Glypta fumiferanae ichnovirus（11/30）、Monkeypox virus（10/30）。亦有匹配到双链RNA家族:Human coxsackievirus B3（4/30）、Midway virus（6/30）、Nyamanini virus（6/30）。以动物病毒为主,而噬菌体也是一种重要成分,例如噬菌体Rhodococcus phage（14/30）、Mycobacteriophage（10/30）、Gordonia phage（6/30）。经过分析,筛选出一株潜在的噬菌体序列,并通过反向PCR及基因组步移技术克隆了该病毒的部分基因组,经序列比对认为其可能为一种新型的红球菌属噬菌体。随后利用分子流行病学调查的原理和方法,证实了该株噬菌体的流行性在慢性牙周炎患者与牙周健康组之间存在差异并与慢性牙周炎相关。为了能深入研究该噬菌体的结构及功能,课题组试图在体外分离培养该噬菌体,由于潜在宿主菌选择范围过窄等原因尚未能成功。本项目初步揭示了牙周环境内的病毒群落信息,并首次在人体牙周环境中发现了一株疑似红球菌属噬菌体的存在,并证明其检出率与慢性牙周炎的发病存在相关性。本课题的结果为牙周病的预防、诊断及治疗策略提供了新的理论基础。
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