金黄壳囊孢菌(Cytospora chrysosperma)是引起新疆林木腐烂病最主要的病原菌,可以危害杨树、柳树、苹果树、榆树等多种寄主植物,然而不同寄主上的金黄壳囊孢菌在培养性状上表现出一定的差异,为明确不同寄主上金黄壳囊孢菌种内亲缘关系和遗传差异,本研究通过培养特征、Biolog技术及ISSR分子标记技术,对采集自新疆6个地区5种不同属植物上的47株金黄壳囊孢菌进行遗传多样性的分析,主要研究结果如下:(1)从新疆6个地区5种不同属植物上采集的腐烂病样分离、纯化得到47株金黄壳囊孢菌,依据菌落的培养特征将47株金黄壳囊孢菌划分为15种不同菌株类型。(2)运用Biolog技术对15种不同菌株类型金黄壳囊孢菌代谢95种碳源的特性进行分析。结果表明:菌株882利用碳源的丰富度指数及代谢活性较高,菌株812-1利用碳源的丰富度指数及代谢活性最低。不同类型菌株能够共同利用的碳源类型为碳水化合物、羧酸及其衍生物、聚合物、氨基酸。六个菌株存在单独利用的碳源:1074-2利用L-丙胺酰胺、L-谷氨酸;891-1利用L-乳酸、L-苯丙氨酸;847利用溴代丁二酸;896利用L-海藻糖;934利用腺苷;740利用P-羟基苯乙酸、琥珀酰胺酸和L-天门冬氨酸。(3)47株金黄壳囊孢菌基于遗传相似系数进行聚类分析,被划分为两大类群,第一大类群包含14种不同类型菌落形态的菌株,第二大类群的菌株在菌落形态上均属于类型A(白色,子实体小密集型)。47株金黄壳囊孢菌基于遗传距离进行UPGMA聚类分析,塔城、哈密、吐鲁番、五家渠、昌吉的金黄壳囊孢菌亲缘关系较近。(4)从形态学特征、生理生化性状和ISSR标记技术综合分析得出:存在单独利用碳源的6株菌株在菌落特征上表现出不同的类型:740为G型(白色,子实体聚生);1074-2为K型(灰色,无子实体);891-1为F型(白色,无子实体,绒毛松软,无轮纹);847为N型(深灰色,无子实体);896为O型(深灰色,子实体密集);934为H型(桔红色,无子实体)。菌株812-1、904、739、626、919-1、933对碳源利用率最低,在形态类群上全部属于类型A(白色、子实体密集),在ISSR亲缘关系聚类中全部聚为第二大群。