重大突发公共卫生事件不仅严重威胁社会公众的生命健康,而且对社会秩序带来严重损害。2019年末新型冠状病毒肺炎爆发,因其传染性强、传播范围广、影响力强已成为国际关注的重大突发公共卫生事件（PHEIC）。中医药成为了抗击新冠肺炎的“利器”,中医防治疫病的价值以及中医药应对突发公共卫生事件所发挥的重要作用已被证实。习总书记在中央政治局常委会会议上明确要求,“坚持中西医结合,不断完善诊疗方案,使中医药进入防控疫情的主战场。”国家卫生健康委员会和国家中医药管理局联合印发《关于在新型冠状病毒肺炎等传染病防治工作中建立健全中西医协作机制的通知》,要求建立中西医协作机制,更好发挥中医药在新冠肺炎等传染病防治中的作用。从全国的实际应用效果来看,中西医结合治疗在此次疫情防控中发挥了重要作用。因此,研究如何发挥中医和西医协同作用,构建有中国特色的重大突发公共卫生事件治理机制具有重要意义。本文采取文献研究、meta分析法、实地调研、案例分析相结合的研究方法,在协作治理理论和PPRR危机管理理论、治理机制等理论和概念的指导下,首先梳理中西医应对重大突发公共卫生事件的历史沿革,了解中医药和西方医学结合应对传染病的初步实践;其次对中西医结合治疗新冠肺炎进行meta分析,对中西医结合治疗组和常规西医治疗组在总有效率、中医症候量表评分、转（危）重率、CT好转率、病死率、发热消失率等指标进行对比评价;接着选取湖南省B市进行个案分析,对B市抗击新冠肺炎疫情的治理现状进行分析,总结归纳B市中西医应对新冠肺炎疫情存在的问题及原因分析,从而构建中西医结合应对重大突发公共卫生事件的事前预警机制、事中应急救治机制和事后善后机制,并对构建中西医结合应对重大突发公共卫生事件治理机制提出建议:应强化中西医结合应对重大突发公共卫生事件政策制度建设、加强中药应急资源的储备和生产、增加中医药财政投入、提升中医药疫情防控救治能力、培养中西医结合防治传染病人才。