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本研究用从四川省4个花生主产区和2个花生品种上分离的22株花生根瘤菌为研究对象，以B.japonicum、B.elkanii的代表菌株和分类地位未知的其他慢生根瘤菌株Bradyrhizobium sp．为参照，测定了花生根瘤菌的生长速度，采用16S rDNA PCR-RFLP、16S rDNA部分序列(780bp)分析、rep-PCR、AFLP、FAME和DNA-DNA杂交方法，系统地研究了四川花生根瘤菌的遗传多样性和系统发育。试验结果表明：四川花生根瘤菌为慢生型Bradyrhizobium sp.(Arachis)，与分离自以色列和津巴布韦的花生根瘤菌相似。rep-PCR、AFLP和16S rDNA PCR-RFLP分析揭示了四川花生根瘤菌存在高度的遗传多样性。根据REP-PCR和AFLP指纹图谱的相似性进行的聚类分析结果与菌株的分离地和寄主相关，即分离自同一地点或同一种寄主的菌株聚为一群，表明了环境条件对根瘤菌的发育和遗传分化有影响。但是，ERIC-PCR聚类分群的结果与寄主和菌株分离地的相关性不明显。AFLP在反映关系密切的菌株间微小遗传差异性时是一种非常有效的方法。16S rDNA PCR-RFLP分析表明四川花生根瘤菌存在A、B、C、D四种遗传型，绝大多数为B型，在所用的8种限制性内切酶中，Ddel切割的带谱最丰富，是反映慢生根瘤菌16S rDNA序列差异性的最有效的限制性内切酶。16S rDNA PCR-RFLP、16S rDNA部分序列测定、FAME和DNA-DNA杂交分析结果一致表明，花生根瘤菌与B.japonicum的系统发育关系最接近。但是，FAME分析的结果还证明，花生根瘤菌与B.japonicum虽然均含有脂肪酸16：1w5c，但前者的含量显著地高于后者，其它慢生根瘤菌不含这种脂肪酸。依据本试验结果和花生根瘤菌与慢生大豆根瘤菌属于同一互接种族的事实，作者认为花生根瘤菌的确切分类地位应定为慢生大豆根瘤菌种的一个生物型Bradyrhizobium.japonicum biovar arachis。