甲状腺乳头状癌可溶性载体预后模型构建及生物信息分析

来源 :中国医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:johndovl1
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目的:甲状腺癌是最常见的内分泌恶性肿瘤。甲状腺癌中最常见的一种病理类型是PTC。近几十年来甲状腺乳头状癌(PTC)的发病率在世界范围内显著上升,占新发甲状腺癌的90%以上。虽然经过合理的治疗,仍有10-20%的患者出现复发。有必要发展更好的预测PTC复发的方法。在癌症中,SLC转运蛋白的表达模式发生了巨大的变化。可溶性载体家族(SLC)与肿瘤的发生发展关系密切但与PTC复发之间的关系尚不清楚。此外有新的证据表明,SLC12A4在癌症发展中具有功能相关性,但是SLC12A4在PTC中的潜在生物学功能仍未确定。本研究旨在构建一个预测PTC复发的SLC家族基因模型并探究SLC12A4在PTC中的潜在生物学功能。方法:通过分析TCGA数据库中502例PTC的RNA测序数据及相关临床数据,以确定PTC中SLC家族基因的预后价值。分析了SLC家族基因在样品中的表达和功能。聚类分析在数据中确定了两个聚类。采用LASSO COX回归分析和单因素COX回归分析确定风险特征,将患者分为低风险组和高风险组。此外对预后模型进行泛癌分析并通过生物信息学分析SLC12A4在PTC中的潜在生物学功能。结果:88个SLC家族基因在肿瘤组织和正常组织中的表达水平有显著差异。两个PTC聚类具有不同的基因表达。这两组间,SFXN1、SLC12A4、SLC35A1、SLC35E1、SLCO1C1的表达水平有显著差异。高危组和低危组的预后差异显著(P<0.05)。两个亚组在无病生存期(Disease-free survival,DFS)、性别和T分期上有显著的差异。风险评分被确定为一个独立的预后因素(P<0.05)。在PTC患者中,SLC家族基因表达与临床病理因素存在关系。SLC12A4在PTC组织中低表达且与免疫浸润有关。甲基化可能充当SLC12A4表达和生物学功能的上游调节剂。结论:5个SLC基因(SFXN1、SLC12A4、SLC35A1、SLC35E1、SLCO1C1)可建立预测PTC复发的模型,有效预测PTC复发。这个模型还能够很好的预测多种肿瘤的DFS。SLC12A4是PTC预后相关的生物标志物。
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