结核分枝杆菌耐利福平rpoB基因突变的分析与检测

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目的:探讨结核分枝杆菌耐药基因rpoB突变与利福平耐药性的关系,利用核酸导流杂交技术快速检测rpoB基因突变。方法:收集81例结核分枝杆菌临床分离株,PCR扩增rpoB含利福平耐药决定区域在内的基因片段,对全部81例标本的PCR产物进行测序分析并与利福平药物敏感试验结果进行比较,选取包括20例测序存在突变的标本和11例测序为野生型的标本在内的共31例标本进行导流杂交,结果与测序结果进行对照,用TA克隆产物做阳性对照。结果:81例结核分枝杆菌临床分离株中,27例耐利福平菌株中20株发生rpoB基因突变(74.1%),突变位点包括531和526在内的7个位点10种突变类型,并发现新的突变位点和突变形式,目前已被美国GeneBank收录;54株敏感株中,1株发生突变(1.9%)。31例标本的导流杂交与测序结果对比显示,14株杂交为野生型,测序发现3株存在突变,17株杂交存在突变,测序结果与之吻合,敏感度为85%,特异性为100%,阳性预测值为100%,阴性预测值为78.6%,薄膜杂交检测与DNA测序结果符合率为90.3%。TA克隆标本杂交结果与预期结果一致。结论:rpoB基因突变是导致结核分枝杆菌耐利福平的主要机制之一,其突变形式存在一定的区域差异;通过核酸薄膜导流杂交技术可以快速、简便、灵敏地检测结核分枝杆菌rpoB基因突变。
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