本文论述了我国生态环境损害赔偿协议司法确认的若干重点问题。我国施行生态损害赔偿制度的根本目的在于对生态环境损害本身进行救济,最终的目标是防止环境要素不利改变和修复生态系统,在救济方式上追求及时性。目前我国对生态环境损害的救济方式有两种:诉讼和磋商。之所以在诉讼之外另设“磋商”的救济路径,是因为传统的诉讼方式程序复杂、耗时长,不能满足生态环境赔偿及时性的要求,而“磋商”能促使赔偿权利义务人尽快根据评估报告达成赔偿协议、制定修复方案,使生态环境修复工作尽快提上日程,也就是说,生态环境损害赔偿磋商制度是为弥补传统诉讼方式缺乏及时性的要求而设计的。但是生态环境损害赔偿制度引入磋商程序又产生了新的问题:磋商的性质属于民事性质,其达成的协议在效力上缺乏强制执行力,若当事人在达成协议后或者履行协议的内容时反悔,将使协议难以落实,最后只能启动诉讼程序,使得生态环境损害纠纷最终还是依赖于诉讼方式解决,这样不但使磋商失去了其本身具备的优势,而且生态环境损害赔偿案件的解决将耗时更长。本论文主要分为三个部分,首先论述生态环境损害赔偿协议司法确认的提出与实施现状,再通过对实施现状的分析提出几个关键问题,最后从关键问题中探索生态环境损害赔偿协议司法确认制度的构建。本论文研究的目的在于通过研究生态环境损害赔偿制度引入司法确认程序的现状与问题,探索如何构建生态环境损害赔偿协议司法确认制度,助推生态环境损害赔偿制度的各项制度不断健全和完善。