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卤虫(Artemia)属于甲壳纲(Crustasea)，鳃足亚纲(Branchiopoda)，无甲目(Anostacea)，卤虫科(Artemidae)，卤虫属(Artemia)，通常分布于内陆盐湖和海岸盐田中。卤虫分为两性生殖和孤雌生殖两大类，目前世界上比较有说服力的分类方法是把世界上的两性生殖卤虫分为6个种，分别为：A.franciscana,A.persimilis,Amonica,A.urmiana,，A.sinica，A.tunisiana,。把世界各地的孤雌生殖卤虫定名为孤雌卤虫复合种A.parthenogenetica。随着分子生物学技术的发展，分子进化已经成为近年来进化生物学研究中的一个重要方面。本文采用PCR直接测序方法首次对11个地区的两性生殖卤虫和10个地区的孤雌生殖卤虫的Hox基因家族中的abdA基因和Dfd基因序列进行了测定，用ClustalX1.8软件对比并用MEGA2.1软件分析其碱基组成及变异情况，abdA基因以红蚂蚁OecophyllaLonginoda作为外群构建分子系统树，Dfd基因以家蚕Nereis作为外群构建分子系统树。经对位排列后，两性生殖卤虫的abdA基因部分序列均包括304个碱基，含有31个变异位点，种间序列差异值为0.8％～8.0％；Dfd基因部分序列包括401个碱基，含23个变异位点，种间序列差异值为0％～4.3％之间.孤雌生殖卤虫abdA基因部分序列均包括304个碱基，含有23个变异位点，种间序列差异值为4.0％～5.7％两个基因均未见有插入和(或)缺失。论文中还比较了8个地区卤虫品系的abdA基因序列，其中含有30个变异位点，种间序列差异值为1.5％～7.3％。根据p-distance模型，构建NJ树、ME树，基于abdA基因与Dfd基因部分序列分别重建的系统树都将11个地区的两性生殖卤虫分为四个种：A.franciscan、A.persimilis、A.urmiana、A.sinica。同属于A.franciscan的GSL和SFB聚到一起，A.franciscan和A.persimilis聚到一起，因此，二者间的亲缘关系比较近，来自西藏的MD和QXC聚在一起，来自哈萨克斯坦的卤虫与西藏卤虫亲缘关系比较近，来自内蒙古的3个地区的卤虫聚在一起，运城的卤虫与内蒙古的卤虫聚在一起，而来自伊朗的A.urmiana处于西藏和内蒙卤虫之间。孤雌生殖卤虫分为两支，内陆和沿海地区。其中内陆这一支中新疆和青海的卤虫先聚在一起，而内陆其他三个地区的卤虫聚在一起。