在经济全球化的背景下,构建区域创新系统是我国积极参与国际竞争的必然要求,同时也是地方经济社会长久、快速发展的迫切需要。由于地理、历史的原因,我国西部地区的区域创新系统建设仍存在多方面的问题,区域创新体系尚处在不发达阶段。地方政府作为区域创新系统的重要组成部分,突出表现在凭借其特殊的身份完成其他创新主体无法实现的系统功能。因此,研究并发现西部地区地方政府在构建区域创新系统中存在的问题,并给予相应的对策建议,能更好的促进西部地区区域创新系统的建设,进而促进西部地区经济的发展。本文首先梳理和总结了国内外区域创新系统中政府行为的相关文献,在前人研究的基础上,构建了区域创新系统中政府行为绩效评价指标体系和选取了科学合理的评价方法。其次,以西部11个省市(西藏除外)为研究对象,使用2006年-2015年十年的数据,采取熵权法和动态综合评价法对这西部11个省市政府行为绩效进行评价及排序,并使用Ward系统聚类法对地方政府行为绩效进行聚类分析。再次,从构建的指标体系入手,详细分析这11个省市的一级指标得分情况,找出它们在区域创新系统建设中存在的不足之处。最后,结合不足之处,提供相应的对策建议。研究结论主要包括:1、西部地区区域创新系统中政府行为绩效综合排名为:四川>陕西>重庆>广西>内蒙古>贵州>云南>甘肃>新疆>青海>宁夏。2、在本文所构建的指标体系中,创新软环境综合指标和创新投入综合指标所占比重较大。西部地方政府在营造区域创新系统中,应着重加强对这两方面的行为优化,以期快速提高本区域的创新能力,但其余的创新硬环境和社会效应这两方面的行为也要兼顾。3、我国西部地方政府在建设区域创新系统时普遍存在以下方面的问题:(1)区域创新科技投入不足;(2)创新硬环境建设还不健全;(3)创新软环境建设还不健全;(4)社会效应还不显著等等。因此,各个地方政府应结合自身的实际发展情况,有针对性的优化政府行为,以期快速提高本区域的创新能力。