猕猴是一种灵长类动物。众所周知,灵长类动物是所有类别动物中和人类细胞和基因的相似度最高的一种物种。所以猕猴作为神经实验的标本相比之于大鼠和壁虎等其他类别的实验标本更能够为人类的神经实验有更多的帮助。很多猕猴的研究结果可以不需要太多改变就可以使用在人类身上。本文针对于猕猴的脑组织切片而进行细胞分割和跟踪等实验,目的是为了弄清猕猴的神经系统中细胞的形态结构和连接方式,为以后进一步的研究打下坚实的基础。脑组织的切片的扫描图像的分割和其他细胞分割有着很大的不同。首先,脑组织切片的扫描图像中会出现很多细小的线粒体在细胞中间,这就导致了其来源于本质的杂质多的问题；其次,细胞的切片中会存在细胞核这种很明显的细胞器,这也使得图像得分割变得更有难度。而现在研究的大多数是对于一个完整的细胞进行分割,而这相对于我们这个实验难度大大降低。本文使用了多种现在流行的图像分割方法来解决单幅细胞分割的问题,同时改进了主动轮廓算法来使得其抗噪能力有了比较大的改进。单幅图像上的细胞分割不足以弄清整个细胞的形状,所以在单幅细胞的基础上,我们必须要进行多层细胞之间的跟踪匹配,从而能够弄清整个细胞的形状。所以在上面工作的基础上,我们提出了用于多层脑组织扫描图上的对于单个细胞的跟踪匹配方法。我所做的工作的第二部分是直接在宏观上研究细胞连接的技术。我们现在经常使用弥散张量成像(DTI)技术来研究神经的连接问题,但是对于DTI技术是否合适,其参数应该如何配置的问题却没有合适的论证和研究。为了填补学科上的漏洞,验证DTI技术使用在神经连接研究上的可行性,我们通过结合多尺度的实验结果做了相关研究。最后结合实验结果找到了一些作为不同猕猴间具有极大相似性的神经束。