SWI/SNF染色质重塑复合物在人胚胎干细胞中的组成及其作用伴侣的研究

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SWI/SNF是一种在进化上保守的ATP依赖的多亚基染色质重塑复合物,其核心亚单位BRG1或BRM具有ATP酶活性,它们利用水解ATP释放的能量来改变染色体的结构,从而改变转录调控因子对核小体DNA的可接近性,进而实现对基因表达的调控。研究发现SWI/SNF在细胞的多个生理过程中具有重要作用,如转录调节、细胞周期等。目前在胚胎干细胞中有关SWI/SNF复合物的相关报道,多数是在鼠的胚胎干细胞(Mouse embryonic stem cell,MES)中的研究,尚无在人胚胎干细胞(Human embryonic stem cell,HES)中的报道。我们利用蛋白质免疫印迹、快速液相层析、蛋白质免疫共沉淀和质谱分析等实验技术对SWI/SNF染色质重塑复合物在HES中的组成及其分子伴侣进行了探究。快速液相层析实验结果表明,BRG1、BAF155和BAF170存在同一复合物中,蛋白质免疫共沉淀实验发现,BRG1可以共沉淀BAF155、BAF170,同时,BAF155、BAF170也可以共沉淀BRG1,说明在HES中BRG1,BAF155、BAF170相互作用。另外,我们发现SWI/SNF组分在HES、MES和HELA中及分化中的HES、MES中的表达存在很大差异,同时,我们的功能实验发现,在HES中BRG1、BAF170的减少导致ES分化,BAF155的降低没有明显的表型。这些结果表明,虽然它们存在于同一复合物中且相互作用,但功能却有很大差异。为了进一步探索SWI/SNF复合物在HES中的组成及其功能差异的分子机制,我们利用BRG1、BAF155和BAF170免疫共沉淀然后进行质谱分析。结果显示,在HES中至少17种SWI/SNF亚单位存在于复合物中,且亚基的组成与MES也存在差异。另外,发现SWI/SNF相关因子存在于细胞的多个生理过程。另外,BRG1、BAF155和BAF170的分子伴侣有交集也存在差异,也进一步说明了不同SWI/SNF组分功能差异的机制。综上所述,SWI/SNF染色质重塑复合物在人胚胎干细胞中有特异性的组成,其功能的特异性与其不同的分子伴侣有关。
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