散发性帕金森病microRNA表达谱研究和靶基因预测

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目的:通过microRNA(miRNA)芯片技术研究散发性帕金森病(PD)患者血浆中miRNA的表达谱,进而筛选出有差异表达的miRNA并进行靶基因预测。方法:选取散发性PD患者6人,根据有无开-关现象将其分为T1、T2两组,其中T1组为无开-关现象的患者3名,T2组为有开-关现象的患者3名,并按年龄性别匹配选取健康对照组3名定为C组。从9名实验对象中采集静脉血5ml于EDTA抗凝管中,提取总RNA,利用基因芯片技术筛选散发性PD患者与健康对照组差异表达的miRNA,将数据归一化后用T检验分析分化表达的miRNA的统计学差异。选取T<0.05,表达倍数相差两倍或以上的miRNA进行聚类分析和相关性分析。最后对T1、T2组共表达的miRNA进行靶基因预测。结果:T1、T2与C组血浆中miRNA的表达有显著差异,T2组差异性更大,T1和T2之间有共同表达的miRNAs,其中表达上调的是hsa-miR-589-3p和hsa-miR-302e;下调的是hsa-miR-5582-3p,hsa-miR-4483,hsa-miR-4481,hsa-miR-4501,has-miR-2113,has-miR-493-3p和has-miR-5001-3p。hsa-miR-4483可以预测到靶基因LRRK2,miR-302e、-589-3p、-5582-3p、-4481、-4501、-2113、-493-3p和-5001-3p可以预测到基因GIGYF2,miR-302e、-589-3p和-4481可以预测到基因EIF4G1。结论:散发性PD与正常对照组有不同的miRNA表达谱,miRNA可能参与了散发性PD的发病发展过程,差异表达的miRNAs可能成为诊断和治疗的新靶点。
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