为了探寻导致鸡常染色体矮小(autosomal dwarfism,adw)性状的主效基因,本实验主要从以下几个方面进行了研究:1.根据前人的初步定位结果结合比较基因组学手段,在鸡的1号染色体上确定一段长度为2.7Mb,包含52个基因的物种间同线性保守区域作为研究adw的候选区间。以荷兰瓦大两个常染色体矮小鸡家系中正常体型个体与adw个体的DNA以及科尼什矮小公鸡和白莱航矮小公鸡的精子库DNA为材料,对候选区间基因的功能区域进行测序比对,获得39个与adw性状有一定连锁的SNP标记,包括来自4个不同基因的9个非同义突变。2.运用PCR-RFLP技术,对上述4个候选基因中发现的功能SNP标记与adw性状的连锁情况进行分析,结果显示ASCL4基因外显子1中的一个引起脯氨酸转变为亮氨酸(P-L)的C/T非同义突变仅存在于adw家系品种中。进一步运用PCR-RFLP技术对11个非相关的adw家系的所有个体检测此位点基因型,结果表明纯合的T等位基因型与adw性状完全连锁。3.运用焦磷酸测序技术对包括27个中国地方鸡种、1个性连锁矮小鸡品种以及1个原因不明的国内常染色体矮小鸡品种在内的870个个体检测ASCL4基因外显子1中发现的特异SNP位点。结果显示,国内各种体型鸡均只有正常的C等位基因,而未检测到该位点上与矮小性状相连锁的T突变等位基因,说明该SNP位点具有极强的特异性,为adw家系所特有。4.实时定量PCR检测ASCL4在正常白莱航鸡的不同发育时期,不同组织中的表达情况。结果表明,胚胎期ASCL4主要在大脑、躯体和皮肤中表达,出壳一周龄主要在皮肤中表达,且表达量较胚胎期要高,其他组织除肌肉外表达量都很低。现有研究结果表明ASCL4还具有DNA结合功能及转录调控活性。综上所述,ASCL4非常可能是导致鸡常染色体矮小性状的主效基因。