钩体病，也称Weils病，是一类常见的人兽共患病。我国也是钩体病的高危国家之一，其在我国是乙类传染病。　　2003年以来，钩体已经完成了有7株的全基因组测序工作，由于钩体独特的进化地位，约有40％的CDSs编码未知功能蛋白。另外，钩体一直都缺乏有效的遗传操作手段，导致钩体病的致病因子尚未完全阐明，其诊断和疫苗也缺乏有效的免疫靶标。　　本研究首先以问号钩体56601株为研究对象，借助钩体无蛋白疫苗培养基C-70，获得了56601株的分泌上清，并通过LTQ-MS/MS的方法鉴定其分泌蛋白质组，结合生物信息学分析，得到了33个高度可信的钩体分泌蛋白。并且发现了15个在体内上调和2个下调基因，对新发现的4个体内显著上调的脂蛋白—LA_2413、LA_2823、LA_3469以及LB_194进行功能实验，发现LA_3469与LB_194能够粘附Laminin、CollagenⅠ、CollagenⅣ以及Casein，而LB_194还能粘附Fibronectin。这说明LA_3469与LB_194在钩体与宿主粘附过程中发挥作用。　　本研究优化了传统逆向疫苗学表面暴露蛋白预测策略，并以我国钩体病疫苗代表菌株—56601株、JDL03株及JDL10株为研究对象，对三株钩体的表面暴露蛋白进行预测，建立了钩体的预测表面暴露蛋白质组。同时，借助质谱技术系统性地鉴定了三株钩体包括分泌和外膜蛋白在内的表面暴露蛋白质组。并将预测和实验验证的表面暴露蛋白质组进行整合，最终，问号钩体56601株、JDL03株及JDL10株分别获得了154个、186个以及139个表面暴露蛋白，有81个蛋白在三株钩体中保守。而其中有10个蛋白在17个问号钩体血清型中也高度保守，包括了已经验证过的疫苗候选靶标—LipL32与LA_3469。进一步的实验发现了两个新的钩体疫苗靶标—LA_0505与LA_0136，其中LA_0505的抗血清能够与我国流行的15群15型有交叉反应，说明该蛋白是较好的钩体病疫苗候选靶标。除此之外，我们利用建立的表面暴露蛋白预测方法，分析了PATRIC网站上发布的17株不同MLST分型的钩体的表面暴露蛋白，建立了问号钩体保守的预测表面暴露蛋白质组库，共有190个蛋白;这其中筛选得到的保守蛋白将有利于钩体免疫靶标的进一步筛选。此外，还筛选得到了部分血清型的型特异性表面暴露蛋白基因。　　本研究借助转录组测序及iTRAQ定量蛋白质组技术，比较56606v株及其减毒株56606a株在模拟体内培养温度条件下的转录及蛋白水平差异分析导致两株毒力差异的关键因子。在转录组水平，56606v株有159个基因上调表达，而有402个基因下调表达;在蛋白质组水平，56606v株有115个蛋白上调表达，105个蛋白下调表达;转录/蛋白水平差异一致的基因/蛋白共有94个，其中有44个为56606v株上调表达。对上调一致的基因/蛋白分析蛋白-蛋白相互作用网络，发现钩体脂蛋白LipL36与LipL48是连接TonB系统与趋化系统的两个关键因子。趋化蛋白CheW3蛋白能够与氧应激反应蛋白KatE发生相互作用，而KatE蛋白被证明只存在于致病性钩体中，并且其与致病性钩体适应宿主体内环境氧应激反应相关。这提示TonB系统与趋化系统的表达上调蛋白可能作为重要致病因子在钩体致病过程中发挥关键的作用。