斑石鲷免疫相关基因rpl10和TGF-β1克隆及表达分析

来源 :上海海洋大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:jql002
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
随着我国经济建设取得了巨大成功,人民生活水平得到了很大提高,人民对水产品类型和质量的要求也在不断提高,这就使很多水产养殖公司大力引进不同种类的水产品,涌现出了很多新型养殖品种,而斑石鲷就是其中一种。斑石鲷是一种在形态学分类上隶属于鲈形目、石鲷科、石鲷属的中型鲷科鱼类,主要分布在环太平洋的东北部沿海地区,包括中国、日本、朝鲜等地的沿海地区,属于温热带生活习性鱼类。斑石鲷因其肉质鲜美晶莹剔透,蛋白质含量丰富,营养价值较高,因此具有较高的食用和药用价值;又因其体态优美,体色靓丽,具有一定的观赏价值;还因其很难被垂钓,被垂钓者称为矶钓之王,具有一定的垂钓娱乐价值。这些都使斑石鲷成为市场上非常受欢迎的水产种类,逐步发展成为一种具有较高价值的水产养殖种类。然而在斑石鲷养殖过程中爆发的大规模斑石鲷虹彩病毒病,很大程度上限制了斑石鲷养殖产业的健康、快速发展,给养殖者造成巨大的经济损失。本论文主要通过克隆和分析与斑石鲷抗虹彩病毒有关的免疫基因,初步分析斑石鲷抗虹彩病毒的免疫应答机制,希望为深入研究鱼类抗病机制特别是斑石鲷抗病毒机制和抗病家系建立提供理论基础。1斑石鲷rpl10基因克隆和表达分析虹彩病毒科是一种感染水生生物的常见病毒种类,其具有广泛的水生动物感染谱,包括海水、淡水鱼类、贝类、两栖类、水生爬行类等。近年来,斑石鲷虹彩病毒(SKIV)因其造成的死亡率高、经济损失严重而引起了人们的特别关注。核糖体蛋白L10基因(rpl10)参与了动植物抗病毒的负反馈调节过程。为了说明它们在斑石鲷抗病毒中的免疫作用,我们克隆了rpl10并在本研究中研究了其转录水平的变化。rpl10基因组序列的长度为3463 bp,由6个外显子和5个内含子组成,其中1473bp的转录产物编码215个氨基酸蛋白。组织表达分析显示rpl10分布广泛在所检测的各个组织中,而免疫相关组织(肝脏和肾脏)的表达较高。在三个组织(脾脏、肝脏、肾脏)中进一步检测了SKIV感染后的不同时间点的转录水平的变化。在脾脏和肝脏中可观察到SKIV感染后的显著上调,并且峰值出现在感染后第4天。本研究有助于进一步研究rpl10在斑石鲷抗病毒防御中的作用。2斑石鲷TGF-β1基因克隆和表达分析虹彩病毒可以广泛感染水生动物,对水产养殖业危害巨大。虹彩病毒是造成现阶段斑石鲷工厂化养殖过程中大规模死亡的主要病原,其感染力极强,感染后的斑石鲷死亡率高,严重影响了斑石鲷养殖产业发展。转化生长因子TGF-β1是一种重要的免疫调节因子,在病毒免疫应答中发挥重要作用。为研究TGF-β1在斑石鲷被虹彩病毒感染过程中发挥的作用,运用RACE和实时荧光定量qRT-PCR技术对TGF-β1进行了基因克隆,并对其进行在不同组织,不同时间点相对表达量的差异分析。结果显示:斑石鲷TGF-β1基因cDNA序列全长为3157 bp,5’非编码区长712bp,3’非编码区长1278 bp开放性阅读框长1167 bp,编码388个氨基酸,基因组包含6个外显子和5个内含子。同源分析发现TGF-β1在鱼类中的相似度较高,斑石鲷与半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevis)的同源性最高,为76.67%。TGF-β1在斑石鲷健康组织(肝脏、脾脏、肾脏、头肾、心脏、鳃、胃、肠和皮肤)中均有表达,在头肾、肠,肝脏和皮肤组织中表达量较高,而在脾脏和肾脏组织表达量较低。为进一步研究TGF-β1在病毒感染过程中的相对表达量的变化,我们对健康的斑石鲷注射虹彩病毒进行刺激,随后比较了TGF-β1在脾脏、肝脏、肾脏和头肾4个不同组织、不同时间点的相对表达量的差异,在头肾、脾脏和肝脏中,病毒刺激后TGF-β1的表达量均出现升高,但在脾脏和肝脏中,峰值出现在刺激后第4天,而在头肾中峰值出现在感染后第10天。在肾脏中,病毒刺激后的TGF-β1的表达呈现下降趋势,0天表达量最高,4天、7天依次降低,7天降至最低,10天有所恢复。以上研究表明,TGF-β1可能响应了虹彩病毒对机体的刺激,可能在对病毒免疫应答中发挥作用。而病毒感染后不同组织中TGF-β1相对表达量的差异,则值得进一步研究。
其他文献
公元前四世纪后半叶至公元前一世纪初在古希腊史上是一个动荡不安,刀兵扰攘的年代.随着亚历山大的征服,希腊文明迅速传播到东方各国,一些西方学者据此将这一代时称为所谓"希
在城乡统筹发展逐步推进的今天,我国农村水环境污染问题日益突出,已成为建设“美丽乡村”和“美丽中国”的重要瓶颈。这就倒逼我们需要对农村量多面广的分散型污水处理进行传
目的:通过搜集、分析急性重症胰腺炎局部腹壁并发症的CT、MRI平扫及增强扫描表现,并观察腹壁并发症与胰腺炎严重程度的相关性,以期做出更为全面、详尽的急性重症胰腺炎影像诊
目的:探究肝动脉化疗栓塞(transarterial chemoembolization,TACE)联合射频消融(radiofrequency ablation,RFA)治疗BCLC中晚期肝癌患者的中位无疾病进展生存期、中位生存期及影响两者的因素。方法:纳入我科于2010年2月-2015年8月之间收治的采用TACE联合RFA治疗的BCLC中晚期肝癌患者共66例。回顾性搜集随访数据,使用SPSS19
黑龙江省大兴安岭地区属于寒温带大陆性气候,2015年自四川引进羊肚菌人工种植技术,结合本地区气候特点,对种植过程中菌种选择、栽培种制作、播种日期及田间管理进行优化,经过
夏直播花生通过与小麦接茬种植,可以实现小麦、花生一年2熟,是解决粮油争地矛盾、提高土地产出效益、保障粮油供给安全的有效途径。为明确小麦-夏直播花生(W-P)种植体系的碳足
亲水胶体常用作增稠剂、胶凝剂、稳定剂、乳化剂添加到加工食品中。裂片石莼(Ulva fasciata)是一种来源丰富的绿藻,研究表明从中提取的多糖是一种粘稠的大分子多糖,具有亲水胶
报道了河南省栾川县秋扒乡晚白垩世秋扒组发现的甲龙类化石。化石包括单枚牙齿、一几乎完整的背椎体、不完整的肋骨和坐骨。虽然化石材料少,难以确立属种,但是这是除中原龙产
目的:测定不同孕周时GDM(Gestational Diabetes Mellitus,妊娠期糖尿病)患者及正常孕妇的血浆内脏脂肪素(Visfatin)、空腹胰岛素、空腹血糖等指标,分析内脂素与孕周变化的关
随着江西省水利工程,尤其是堤防工程的不断推进,在江西省堤防工程建设中推广和使用生态护坡成为当前的重要课题。本文从我省建设生态护坡为出发点,通过野外实地调查、结合长