CLIC6在肺腺癌中的生物学功能及预后评价

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目的:氯离子胞内通道蛋白6(CLIC6)作为氯离子胞内通道家族(CLICs)的重要成员,具有复杂的生理和病理功能。同时,该基因在多种肿瘤性疾病的发生及发展过程中发挥着关键的作用。但是在肺腺癌中,CLIC6所发挥的生物学功能仍然不清楚。本研究的主要目的是探究CLIC6在肺腺癌中的表达特征、生物学功能以及预后价值。方法:在本研究中,我们首先对癌症基因组图谱(TCGA)RNA测序数据库中的510例肺腺癌患者的CLIC6基因表达特征进行了综合分析。其中,T检验及方差分析用于探究组间差异的统计学意义,Kaplan–Meier生存分析,单因素与多因素COX回归分析用于评估CLIC6在肺腺癌中的预后价值,主成分分析(PCA)、GO分析及基因表达富集分析(GSEA)等生物信息学分析方法用于探究目的基因在肺腺癌的发生和进展过程中发挥的主要生物学功能。GSE30219、GSE50081和GSE40791表达谱数据库作为验证组对以上分析结果进行进一步验证。为进一步探究CLIC6在蛋白质水平的表达情况,选取114例来自天津市肿瘤医院的具有完整临床随访信息的病理样本进行了免疫组化染色,采用阳性细胞百分率与阳性细胞染色强度的乘积作为评分,并由两位高年资病理学家双盲阅片,Kaplan–Meier生存分析用于评价CLIC6蛋白质表达水平与患者预后的相关性。R语言及SPSS 16.0为本研究的主要分析及绘图工具。结果:通过数据分析我们发现CLIC6的m RNA表达水平在肺腺癌早期(I期,国际抗癌联盟最新版肺癌TNM分期)相对于中晚期(II、III+IV期)较高,并且发现随着瘤体增大(T分期)、淋巴结转移级别升高(N分期)、肿瘤发生远处转移(M分期),CLIC6的表达量也有不同程度的下降,提示其与肺腺癌的进展,包括肿瘤细胞增殖、淋巴结及远处转移存在相关性。生存分析、单因素及多因素COX回归分析结果提示CLIC6的表达水平为与肺腺癌预后相关的一个独立因素,通过卡方检验发现,除肿瘤的TNM分期外,CLIC6基因高表达组与低表达组的患者各临床特征及分子标志物分布的组间差异无统计学意义,提示CLIC6可能是通过与当前肺腺癌中较为熟知的EGFR、KRAS、TP53等不同的分子机制发挥作用。为探究CLIC6相关的作用机制,首先进行了PCA分析,结果显示CLIC6高表达组与低表达组的样本其m RNA的表达特征存在显著差异,进一步的GO和GSEA功能分析表明,分析结果显示CLIC6的表达水平与细胞周期、细胞分裂、细胞增殖、细胞外基质粘附以及NIK/NF-kappa B信号通路等呈显著负相关,与离子的跨膜转运等生物学功能呈正相关,提示CLIC6可能与内环境稳态的维持及细胞正常的增殖、分裂相关。免疫组化实验结果显示,免疫组织化学评分与TNM分期、瘤体大小、淋巴结转移水平均呈现明显的负相关,而免疫组织化学评分较高的患者其总生存期(OS)和无进展生存期(PFS)均显著延长,从而在蛋白质水平验证了生信分析结果并进一步提示CLIC6对肺腺癌患者的预后价值。结论:CLIC6作为CLICs家族的重要成员在肺腺癌的疾病进展过程中发挥着至关重要的作用,此外研究结果显示该基因可以作为肺腺癌的新的独立的预后因素并且有成为新的治疗靶点的潜力。这一发现对肺腺癌的个体化治疗具有重要的参考价值。
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