孙应鳌是贵州文化史上一位重要人物。他生活于社会正发生激烈转型的中晚明时期。当时社会的复杂诡谲，学术的活泼灵动极大影响了孙应鳌学术体系的形成和发展。孙氏学说一面受其时社会环境之影响，一面又对社会作出了积极的学术回应。其学以心为本，以慎独与诚敬为工夫，以人伦日用为下手处，以实现与天地万物一体同仁为最高境界。 本文依据现存孙氏文集及相关史料用五部分对孙氏思想进行了梳理，在力图还原中晚明学术语境的情况下，对孙氏思想作较为准确的现代话语诠释。导论部分简述中晚明学术格局，以明了孙氏所处之学术环境；第一章介绍中晚明的儒学活动，并将孙氏置于其中以作讨论，考察孙氏思想所由生之时代特征；第二章展示孙氏生平及其交游，点明师友对其学问之影响；第三章详述孙氏心本体论与一贯境界论，述其学说中占有重要位置之“心"的概念，以及“心”之活动状态与一贯境界论的理论基础和实现法门；第四章着重说明孙氏之工夫论，阐述慎独与诚意在其思想中的地位和意义，指出工夫论在修身、为学方面的具体表现。