随着我国经济的快速发展,城镇化的进程也在逐步推进,全国各城市都在进行空间的扩张与服务的完善。城市基础设施为城市发展提供着物质基础,在城市的建设中是最基础的环节。近年来我国对于基础设施建设的投入在逐渐提高,基础设施也在进一步完善过程中,基础设施建设对于提升城市的承载力具有重要意义。但面对如火如荼的城市基础设施建设,提高效率比起推进建设进程是更重要的事情。文中结合城市基础设施建设对城市经济增长、社会发展、生态环境的外部性作用,整合城市基础设施在人力物力财力的投入到基础设施的建成再到对经济社会发展的作用两阶段的投入产出指标,通过网络DEA两阶段链式方法,对我国67个大中城市的基础设施建设效率进行实证分析。在效率分析时分别从各阶段综合效率、技术效率与规模效率来看我国大中城市的基础设施建设效率,进行分地区与聚类分析并根据Malmquist指数模型进行动态分析。结果显示我国城市基础设施建设效率近几年整体偏低,投入产出有效的城市很少,分阶段效率也存在不协调的问题,并且具有地区差异,需要优化投入产出结构,改善技术管理方式,协调提高基础设施建设效率。