Pif1家族解旋机制的结构基础研究

来源 :浙江大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:liongliong570
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
Pif1蛋白是解旋酶SF1B超家族成员,能够利用ATP水解提供的能量,对双链DNA(dsDNA),DNA/RNA杂合体,G4 DNA(G-quadruplex DNA)进行5→3方向的解旋,是生物体内非常重要的一类解旋酶。由于其结合底物的多样性,Pif1参与了细胞中多种生物学过程调控。Pif1可以通过解链端粒酶模板RNA与端粒DNA,使端粒酶从端粒游离下来,从而调控端粒的长度。在复制及转录过程中,Pif1能够迅速解开G4结构,维持基因组稳定性。Pif1还参与了冈崎片段的成熟及DNA损伤修复的BIR(Break-induced replication)通路,而且Pif1在核糖体DNA(ribosomal DNA,rDNA)的复制过程及线粒体基因组稳定性维持等方面也发挥了重要作用。  本文主要利用大肠杆菌表达系统,在体外分别构建了酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)ScPif1,人源hPif1,细菌(Bacteroides sp)BaPif1全长及对应的解旋酶结构域(Helicase domain,HD)截短。利用X光晶体衍射技术,解析了细菌BaPif1全长,人源hPif1-HD截短的单体结构,以及BaPif1与单链DNAdT10,与双链DNA dH的复合物晶体结构。对比单体结构与复合物结构发现BaPif1结合DNA后发生了显著的构象变化,2A、2B结构域分别发生了近20°、50°的旋转,并且这种构象变化对于Pif1行使解旋酶功能是必须的;BaPif1与双链DNAH复合物晶体结构显示结合的长链DNA在ssDNA/dsDNA junction处发生了近90°的弯曲,这有利于双链解旋。接着结合生物化学、生物物理、分子与细胞生物学方法对解析的结构进行深入分析,我们又阐述了Pif1家族所特有的signature motif在解旋过程中所起的作用,并提出了可能的解旋模型。本文研究不仅为Pif1维持基因组稳定性的作用提供重要依据,而且为抗肿瘤新药研究提供新的靶点和思路。
其他文献
目前临床上治疗脊髓损伤的手段十分有限,源于脊髓损伤后时间和空间上复杂的病理过程[1,2],这一病理过程由初次的机械损伤及其引发的紧随其后的二次损伤造成[3]。初次损伤引起出
摘要 语言交际能力是人才必备的基本素养。教师在语文教学的过程中,应重视学生的口语交际习惯养成。要尊重学生的学习主体性,引导学生积极投身到教学活动中,从而有效提高学生的口语交际能力。  关键词 学生 交际能力 交际习 惯培养 探讨  口语交际作为一种言语活动形式,是用口说、凭耳听的语言活动。它要求学生在言语交流中,通过规范口头语言,培养语言交际、待人处事、举止谈吐、临场应变、传情达意等的综合能力和基