目前,国际和国内会计准则对合并商誉的计量方法都是针对在非同一控制下的企业合并,将合并成本与可辨认净资产公允价值的差额确认为合并商誉。但由于合并成本的影响因素较多,包括合并双方讨价还价的因素,控股权溢价等,对于发行股票进行合并的企业,合并成本还会受到股票市场的影响,导致合并商誉远大于其实际应支付的价格。因此,这一合并商誉的计量方法容易导致合并商誉的高估。对于合并商誉计量不少学者提出了质疑,但很少有学者提出新的合并商誉计量方法。根据商誉的剩余价值理论,商誉应该为企业价值与企业资产与企业有形资产净值之差。目前对于企业价值的理论研究已经逐渐成熟,但将企业价值与商誉联系起来研究的文献并不多。本文基于商誉的剩余价值理论和企业价值理论,提出商誉应该为企业价值与企业可辨认净资产的差额。但企业价值的评估方法计算复杂且影响自变量的主观因素较多,因此,本文提出用企业市场价值评估企业价值。在合并中,企业价值可以通过股票市场来确定,也就是企业市场价值,那么合并商誉应该为企业市场价值与可辨认净资产的差额。另外,本文根据股票市场与企业价值之间的关系进行了实证分析,通过实证研究,一方面发现股票价格与企业内在价值存在密切的线性关系,可以用股票价格衡量企业价值；另一方面证明长期的股票价格比短期的股票价格更能反映企业价值。最后,本文通过典型案例对基于企业市场价值的合并商誉计量方法进行了验证,说明企业市场价值计量合并商誉的方法是可行的,并且更加合理。