随机广义Cookie-Cutter集与利用Kullback-Leibler散度距离构造脊椎动物系

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本文首先在构造随机广义Cookie-Cutter集的过程中,通过记忆函数,研究了这种有机概率测度序列的紧测度的收敛性.方法是首先构造了[O,T]上的随机广义Cookie-Cutter集KT。令Kn为构造KT中的第n级集合,并在Kn上定义记忆函数。基于这个记忆函数,我们定义了Kn上的随机概率测度Φn(T)。令Ψn(·)=Eφn(·),其中Ψn为随机测度Φn的紧测度。最后证明了序列Ψn是弱收敛的且有Ψ=limΨn.对生物信息问题的研究,我们主要是不通过序列比对,讨论64种脊椎动物的线粒体完全基因组之间的联系,用快速的傅立叶变换(FFT)作用于由蛋白质序列得到的组分向量,然后计算Kullback-Leibler散度距离,用PHYLIP软件包中的NJ(neighbour-joining)方法构造发育树。从系统发育树可以看出这64种线粒体是鱼类和古生物类(包括鸟类和爬行类)。由此建立的树的拓扑结构在很大程度上与已有的脊椎动物的系统发育树是吻合的。
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