【摘 要】
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美国红鱼（Sciaenops ocellatus）属鲈形目（Perciformes）,石首鱼科（Sciaenidae）,拟石首鱼属（Sciaenops）,也称为红拟石首鱼、红鼓鱼等,原产于美国佛罗里达海岸和墨西哥湾沿岸,是世界上最受欢迎的垂钓鱼类之一,于1991年被引进我国。然而,国内对美国红鱼的研究主要集中在养殖方面,该品种的种质资源状况还不清楚。因此,本研究采用形态学标记、线粒体标记、微卫星标
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美国红鱼（Sciaenops ocellatus）属鲈形目（Perciformes）,石首鱼科（Sciaenidae）,拟石首鱼属（Sciaenops）,也称为红拟石首鱼、红鼓鱼等,原产于美国佛罗里达海岸和墨西哥湾沿岸,是世界上最受欢迎的垂钓鱼类之一,于1991年被引进我国。然而,国内对美国红鱼的研究主要集中在养殖方面,该品种的种质资源状况还不清楚。因此,本研究采用形态学标记、线粒体标记、微卫星标记3种方法分析美国红鱼不同养殖群体的遗传多样性,以了解国内美国红鱼的资源现状,为促进美国红鱼养殖业的可持续发展提供理论依据。主要研究结果如下:1.美国红鱼4个不同养殖群体的形态学比较采集了4个不同地区的美国红鱼养殖群体（北海、舟山、珠海、青岛）共计142个个体,测量了8个可量形态学指标,针对6个可量性状比例,利用3种多元统计学方法分析美国红鱼群体间的形态差异。主成分分析得到了3个不相关的主成分,其累积贡献率达80.2%,群体形态差异主要体现在在于尾部和吻部大小。建立了4个美国红鱼群体的判别函数,综合判别率为85.2%。构建的聚类关系树中,珠海群体和青岛群体形态差异较小,舟山群体与其它群体形态差异最大。2.基于D-loop和Cytb对美国红鱼4个群体的遗传多样性分析舟山群体和珠海群体、青岛群体间的Fst值分别为0.0667、0.2270,达到了中度分化和较高水平的分化,基于D-loop序列分析显示舟山群体和北海群体处于较高分化水平,而Cytb序列显示这两个群体间的Fst值为0.2665,达到了高度遗传分化。AMOVA分析显示D-loop序列和Cytb主要以群体内变异为主,变异百分比分别为90.63%和91.58%,说明美国红鱼4个群体变异几乎都发生于群体内部。基于D-loop序列4个群体中单倍型间的遗传距离在0.0012～0.0242,而Cytb单倍型之间的遗传距离在0.0009～0.0115之间。基于D-loop和Cytb序列构建的NJ树结果相同,都分为2大类,北海和青岛群体聚为一类,舟山和珠海群体聚为一类。以小黄鱼（Larimichthys polyactis）作为外类群,分别从个体和单倍型角度,构建D-loop、Cytb序列的NJ分子进化树,结果表明4个群体间未出现明显分化。3.基于微卫星标记美国红鱼4个群体的遗传多样性分析（1）微卫星位点的多态性共筛选出8个高度多态性微卫星位点,其平均等位基因数和平均有效等位基因数分别为30.25和22.607,观测杂合度（HO）、期望杂合度（HE）和香农多样性指数（I）的平均值分别为0.423、0.9671和3.197。多态信息含量（PIC）变化范围0.932～0.972,8个微卫星位点均为高度多态位点（PIC>0.5）。微卫星位点的固定系数Fst在0.014～0.041间（平均0.025）;基因流Nm变化范围为5.865～17.779间。（2）群体遗传多样性4个群体间的等位基因数NA范围是24.25（珠海）～28.5（北海）,平均等位基因数是25.755,4个群体的有效等位基因数NE范围为17.352（珠海）～19.926（北海）,平均有效等位基因数为18.135,NA均大于NE。4个群体的观测杂合度HO为0.381～0.460,舟山群体观测杂合度最低,北海观测杂合度最高。期望杂合度HE为0.940～0.942,珠海群体最低,青岛群体最高,平均观测杂合度和平均期望杂合度分别是0.413、0.941。香农多样性指数（I）的范围为2.996～3.083,结果表明4个群体的遗传多样性都较丰富。（3）群体遗传结构和遗传分化分析美国红鱼4个群体间的Nei’s无偏遗传距离在0.1370～0.3910间,遗传相似度在0.6764～0.8720间,遗传相似度和遗传距离具有一致性。UPMGA聚类树显示舟山群体和珠海群体遗传距离最近,和青岛群体亲缘关系最远。AMOVA分析结果表明4个群体的遗传变异绝大部分来自群体内变异,占比98.20%,遗传分化指标Rst值表明个体间的变异是群体内部变异的主要来源。综上所述,美国红鱼大部分变异属于群体内变异,且个体间变异是群体变异的根本原因,美国红鱼具有较丰富的遗传多样性,单倍型组成具有不均匀性。
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