自主创新是科技进步的核心,是经济发展的不竭动力。本文在综合国内学者的研究成果和国家统计局2005年9月发布的企业创新能力指标体系,构建企业创新活动评价指标体系的基础上,先对中国中部六省大中型工业企业创新投入和创新产出进行描述性统计分析,然后运用DEA中CCR模型和基于DEA的Malmquist指数方法对中国中部六省大中型工业企业自主创新绩效进行评价,在2000-2011年间,中部六省大中型工业企业静态平均技术效率排名依次是湖南、湖北、安徽、河南、江西、山西,动态平均技术效率排名依次是是山西、安徽、湖南、湖北、江西、河南,文章最后分析影响自主创新绩效差异的相关因素,中部六省大中型工业企业未能凭借其规模优势促进创新绩效的提高,市场适度的垄断更有利于创新绩效的提高,加大科技经费支出是提高企业创新绩效的必然选择,加大科技人员的投入,尤其是高技术人员的投入才能有效提高各省的创新绩效。